Protein–RNA interactions for Protein: Q15751

HERC1, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC1, humanhuman

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Length 4,861 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC1Q15751 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HERC1Q15751 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HERC1Q15751 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HERC1Q15751 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
HERC1Q15751 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
HERC1Q15751 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HERC1Q15751 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
HERC1Q15751 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
HERC1Q15751 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC15.06■□□□□ 0
HERC1Q15751 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
HERC1Q15751 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
HERC1Q15751 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
HERC1Q15751 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ 0
HERC1Q15751 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
HERC1Q15751 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
HERC1Q15751 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HERC1Q15751 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
HERC1Q15751 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC15.05■□□□□ -0
HERC1Q15751 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HERC1Q15751 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HERC1Q15751 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HERC1Q15751 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
HERC1Q15751 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC15.04■□□□□ -0
HERC1Q15751 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HERC1Q15751 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HERC1Q15751 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC15.04■□□□□ -0
HERC1Q15751 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HERC1Q15751 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HERC1Q15751 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
HERC1Q15751 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HERC1Q15751 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC15.03■□□□□ -0
HERC1Q15751 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC15.03■□□□□ -0
HERC1Q15751 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HERC1Q15751 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
HERC1Q15751 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HERC1Q15751 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
HERC1Q15751 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
HERC1Q15751 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HERC1Q15751 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
HERC1Q15751 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HERC1Q15751 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
HERC1Q15751 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
HERC1Q15751 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HERC1Q15751 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HERC1Q15751 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HERC1Q15751 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
HERC1Q15751 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
HERC1Q15751 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
HERC1Q15751 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
HERC1Q15751 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HERC1Q15751 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
HERC1Q15751 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HERC1Q15751 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
HERC1Q15751 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
HERC1Q15751 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
HERC1Q15751 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
HERC1Q15751 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
HERC1Q15751 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
HERC1Q15751 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
HERC1Q15751 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
HERC1Q15751 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
HERC1Q15751 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
HERC1Q15751 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
HERC1Q15751 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
HERC1Q15751 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
HERC1Q15751 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
HERC1Q15751 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
HERC1Q15751 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
HERC1Q15751 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
HERC1Q15751 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
HERC1Q15751 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
HERC1Q15751 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
HERC1Q15751 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
HERC1Q15751 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
HERC1Q15751 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
HERC1Q15751 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC14.97□□□□□ -0.01
HERC1Q15751 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
HERC1Q15751 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
HERC1Q15751 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
HERC1Q15751 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
HERC1Q15751 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
HERC1Q15751 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
HERC1Q15751 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
HERC1Q15751 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HERC1Q15751 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HERC1Q15751 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
HERC1Q15751 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
HERC1Q15751 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HERC1Q15751 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HERC1Q15751 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HERC1Q15751 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HERC1Q15751 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HERC1Q15751 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HERC1Q15751 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HERC1Q15751 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HERC1Q15751 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HERC1Q15751 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HERC1Q15751 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HERC1Q15751 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
HERC1Q15751 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
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