Protein–RNA interactions for Protein: Q15365

PCBP1, Poly(rC)-binding protein 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCBP1Q15365 CLSTN3-201ENST00000266546 4185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.53e-14■■■■■ 42.9
PCBP1Q15365 CLSTN3-207ENST00000537408 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.73e-14■■■■■ 42.9
PCBP1Q15365 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.912e-7■■■■■ 42.9
PCBP1Q15365 PHF1-207ENST00000479029 933 ntTSL 218.53■□□□□ 0.562e-8■■■■■ 42.8
PCBP1Q15365 PHF1-204ENST00000427826 862 ntTSL 316.91■□□□□ 0.32e-8■■■■■ 42.8
PCBP1Q15365 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.591e-8■■■■■ 42.7
PCBP1Q15365 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.861e-8■■■■■ 42.7
PCBP1Q15365 AP2M1-212ENST00000461733 1470 ntTSL 216.38■□□□□ 0.211e-8■■■■■ 42.7
PCBP1Q15365 AP2M1-207ENST00000439647 1950 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.071e-8■■■■■ 42.7
PCBP1Q15365 GORASP2-202ENST00000442798 1976 ntTSL 215.72■□□□□ 0.114e-21■■■■■ 42.7
PCBP1Q15365 GORASP2-207ENST00000486498 2096 ntTSL 214.54□□□□□ -0.084e-21■■■■■ 42.7
PCBP1Q15365 GORASP2-209ENST00000493692 951 ntTSL 514.53□□□□□ -0.084e-21■■■■■ 42.7
PCBP1Q15365 GORASP2-201ENST00000234160 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.14e-21■■■■■ 42.7
PCBP1Q15365 BAZ2A-201ENST00000379441 8831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.634e-7■■■■■ 42.7
PCBP1Q15365 BAZ2A-211ENST00000549884 6050 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.731e-7■■■■■ 42.7
PCBP1Q15365 BAZ2A-214ENST00000551812 8600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.744e-7■■■■■ 42.7
PCBP1Q15365 PCBP2-217ENST00000550520 753 ntTSL 312.01□□□□□ -0.491e-17■■■■■ 42.6
PCBP1Q15365 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.526e-8■■■■■ 42.5
PCBP1Q15365 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.26e-8■■■■■ 42.5
PCBP1Q15365 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.786e-8■■■■■ 42.5
PCBP1Q15365 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.366e-8■■■■■ 42.5
PCBP1Q15365 ESYT1-201ENST00000267113 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.71e-6■■■■■ 42.3
PCBP1Q15365 WBP2-209ENST00000589236 747 ntTSL 214.58□□□□□ -0.081e-65■■■■■ 42.3
PCBP1Q15365 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.231e-6■■■■■ 42.2
PCBP1Q15365 TMEM214-208ENST00000460665 1967 ntTSL 215.37■□□□□ 0.053e-11■■■■■ 42.2
PCBP1Q15365 POM121-202ENST00000395270 7011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.153e-6■■■■■ 42.1
PCBP1Q15365 POM121-201ENST00000358357 5320 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.163e-6■■■■■ 42.1
PCBP1Q15365 POM121-205ENST00000627934 5480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.253e-6■■■■■ 42.1
PCBP1Q15365 POM121-204ENST00000446813 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.783e-6■■■■■ 42.1
PCBP1Q15365 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.65e-7■■■■■ 42
PCBP1Q15365 DPAGT1-210ENST00000481084 2343 ntTSL 217.15■□□□□ 0.345e-7■■■■■ 42
PCBP1Q15365 DPAGT1-204ENST00000414373 1638 ntTSL 515.71■□□□□ 0.115e-7■■■■■ 42
PCBP1Q15365 DPAGT1-219ENST00000640747 1813 ntTSL 515.63■□□□□ 0.095e-7■■■■■ 42
PCBP1Q15365 DPAGT1-212ENST00000525456 1020 ntTSL 515.15■□□□□ 0.025e-7■■■■■ 42
PCBP1Q15365 DPAGT1-209ENST00000472016 568 ntTSL 215.07■□□□□ 05e-7■■■■■ 42
PCBP1Q15365 DPAGT1-202ENST00000392834 1817 ntTSL 214.82□□□□□ -0.045e-7■■■■■ 42
PCBP1Q15365 DPAGT1-217ENST00000639704 1719 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.135e-7■■■■■ 42
PCBP1Q15365 DPAGT1-207ENST00000460183 1058 ntTSL 214.23□□□□□ -0.135e-7■■■■■ 42
PCBP1Q15365 DPAGT1-218ENST00000640102 1195 ntTSL 513.37□□□□□ -0.275e-7■■■■■ 42
PCBP1Q15365 DPAGT1-201ENST00000354202 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.315e-7■■■■■ 42
PCBP1Q15365 DPAGT1-206ENST00000445653 583 ntTSL 312.35□□□□□ -0.435e-7■■■■■ 42
PCBP1Q15365 DPAGT1-205ENST00000442480 999 ntTSL 59.41□□□□□ -0.95e-7■■■■■ 42
PCBP1Q15365 TSG101-203ENST00000535077 685 ntTSL 322.12■■□□□ 1.139e-14■■■■■ 41.9
PCBP1Q15365 TSG101-206ENST00000542488 304 ntTSL 54.05□□□□□ -1.769e-14■■■■■ 41.9
PCBP1Q15365 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.822e-6■■■■■ 41.8
PCBP1Q15365 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.526e-7■■■■■ 41.6
PCBP1Q15365 GTPBP3-227ENST00000602056 861 ntTSL 225.86■■□□□ 1.732e-6■■■■■ 41.6
PCBP1Q15365 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.692e-6■■■■■ 41.6
PCBP1Q15365 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.622e-6■■■■■ 41.6
PCBP1Q15365 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.415e-8■■■■■ 41.6
PCBP1Q15365 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.415e-8■■■■■ 41.6
PCBP1Q15365 GTPBP3-217ENST00000598493 808 ntTSL 522.99■■□□□ 1.272e-6■■■■■ 41.6
PCBP1Q15365 CKB-207ENST00000554282 735 ntTSL 222.84■■□□□ 1.251e-9■■■■■ 41.6
PCBP1Q15365 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.235e-8■■■■■ 41.6
PCBP1Q15365 GTPBP3-212ENST00000596125 644 ntTSL 222.59■■□□□ 1.212e-6■■■■■ 41.6
PCBP1Q15365 LRCH4-204ENST00000476881 1675 ntTSL 222.23■■□□□ 1.151e-9■■■■■ 41.6
PCBP1Q15365 AL020996.2-201ENST00000559265 568 ntTSL 422.2■■□□□ 1.145e-8■■■■■ 41.6
PCBP1Q15365 EMILIN1-202ENST00000433140 1431 ntTSL 222.12■■□□□ 1.135e-8■■■■■ 41.6
PCBP1Q15365 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.131e-9■■■■■ 41.6
PCBP1Q15365 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.091e-9■■■■■ 41.6
PCBP1Q15365 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.057e-10■■■■■ 41.6
PCBP1Q15365 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.011e-6■■■■■ 41.6
PCBP1Q15365 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.985e-8■■■■■ 41.6
PCBP1Q15365 EIPR1-204ENST00000435721 672 ntTSL 321.07■□□□□ 0.965e-8■■■■■ 41.6
PCBP1Q15365 EIPR1-203ENST00000406835 738 ntTSL 521.07■□□□□ 0.965e-8■■■■■ 41.6
PCBP1Q15365 GTPBP3-205ENST00000594018 934 ntTSL 520.78■□□□□ 0.922e-6■■■■■ 41.6
PCBP1Q15365 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.917e-10■■■■■ 41.6
PCBP1Q15365 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.91e-6■■■■■ 41.6
PCBP1Q15365 UBL5-206ENST00000589960 307 ntTSL 320.25■□□□□ 0.837e-10■■■■■ 41.6
PCBP1Q15365 UBL5-205ENST00000589372 1450 ntTSL 220.05■□□□□ 0.87e-10■■■■■ 41.6
PCBP1Q15365 LRCH4-205ENST00000485554 774 ntTSL 319.77■□□□□ 0.765e-8■■■■■ 41.6
PCBP1Q15365 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.725e-8■■■■■ 41.6
PCBP1Q15365 SEPT9-215ENST00000586521 601 ntTSL 419.27■□□□□ 0.684e-15■■■■■ 41.6
PCBP1Q15365 EIPR1-205ENST00000441271 647 ntTSL 519.16■□□□□ 0.665e-8■■■■■ 41.6
PCBP1Q15365 CKB-202ENST00000553528 1170 ntTSL 218.94■□□□□ 0.621e-9■■■■■ 41.6
PCBP1Q15365 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.591e-9■■■■■ 41.6
PCBP1Q15365 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.475e-8■■■■■ 41.6
PCBP1Q15365 MEMO1-205ENST00000413686 769 ntTSL 317.72■□□□□ 0.435e-8■■■■■ 41.6
PCBP1Q15365 PTK2-218ENST00000519993 4388 ntTSL 1 (best)17.67■□□□□ 0.425e-8■■■■■ 41.6
PCBP1Q15365 CKB-210ENST00000554989 625 ntTSL 217.55■□□□□ 0.41e-9■■■■■ 41.6
PCBP1Q15365 EIPR1-209ENST00000462515 577 ntTSL 317.37■□□□□ 0.375e-8■■■■■ 41.6
PCBP1Q15365 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.327e-10■■■■■ 41.6
PCBP1Q15365 SEPT9-210ENST00000585929 906 ntTSL 416.76■□□□□ 0.274e-15■■■■■ 41.6
PCBP1Q15365 EIPR1-212ENST00000478754 2932 ntTSL 516.76■□□□□ 0.275e-8■■■■■ 41.6
PCBP1Q15365 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.275e-8■■■■■ 41.6
PCBP1Q15365 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.245e-8■■■■■ 41.6
PCBP1Q15365 SEPT9-233ENST00000590917 541 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.214e-15■■■■■ 41.6
PCBP1Q15365 SLC38A5-213ENST00000620913 1993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.185e-8■■■■■ 41.6
PCBP1Q15365 MEMO1-204ENST00000407893 682 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.185e-8■■■■■ 41.6
PCBP1Q15365 SLC38A5-203ENST00000429543 656 ntTSL 516.14■□□□□ 0.175e-8■■■■■ 41.6
PCBP1Q15365 MEMO1-209ENST00000490459 1242 ntTSL 215.89■□□□□ 0.135e-8■■■■■ 41.6
PCBP1Q15365 SMURF1-203ENST00000472627 825 ntTSL 215.6■□□□□ 0.091e-6■■■■■ 41.6
PCBP1Q15365 SEPT9-212ENST00000586128 752 ntTSL 415.26■□□□□ 0.034e-15■■■■■ 41.6
PCBP1Q15365 LRCH4-202ENST00000467201 4754 ntTSL 215.03■□□□□ -01e-9■■■■■ 41.6
PCBP1Q15365 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -05e-8■■■■■ 41.6
PCBP1Q15365 SLC38A5-210ENST00000595796 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.045e-8■■■■■ 41.6
PCBP1Q15365 SELENON-201ENST00000354177 4227 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.145e-8■■■■■ 41.6
PCBP1Q15365 SELENON-202ENST00000361547 4334 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.155e-8■■■■■ 41.6
PCBP1Q15365 EMILIN1-201ENST00000380320 3943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.175e-8■■■■■ 41.6
PCBP1Q15365 PTK2-202ENST00000395218 4415 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.235e-8■■■■■ 41.6
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