RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000596125.1

GTPBP3-212, Transcript of GTP binding protein 3, mitochondrial, humanhuman

TSL 2

Gene GTPBP3, Length 644 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTPBP3-212ENST00000596125 NISCHQ9Y2I1 1504 aa49.52■■■■■ 5.52
GTPBP3-212ENST00000596125 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa44.17■■■■■ 4.66
GTPBP3-212ENST00000596125 ABCC9O60706 1549 aa43.66■■■■■ 4.58
GTPBP3-212ENST00000596125 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa41.88■■■■■ 4.3
GTPBP3-212ENST00000596125 NACADO15069 1562 aa41.76■■■■■ 4.27
GTPBP3-212ENST00000596125 DCAF8L2P0C7V8 631 aa41.67■■■■■ 4.26
GTPBP3-212ENST00000596125 MYO15BQ96JP2 1530 aa41.43■■■■■ 4.22
GTPBP3-212ENST00000596125 DNAJC5BQ9UF47 199 aa41.2■■■■■ 4.19
GTPBP3-212ENST00000596125 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP41.12■■■■■ 4.17
GTPBP3-212ENST00000596125 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa41.03■■■■■ 4.16
GTPBP3-212ENST00000596125 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP40.77■■■■■ 4.12
GTPBP3-212ENST00000596125 UNC13AQ9UPW8 1703 aa40.6■■■■■ 4.09
GTPBP3-212ENST00000596125 BICRAQ9NZM4 1560 aa40.47■■■■■ 4.07
GTPBP3-212ENST00000596125 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa40.29■■■■■ 4.04
GTPBP3-212ENST00000596125 SCRIBQ14160 1630 aa40.17■■■■■ 4.02
GTPBP3-212ENST00000596125 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP39.52■■■■□ 3.92
GTPBP3-212ENST00000596125 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa39.43■■■■□ 3.9
GTPBP3-212ENST00000596125 CECR2Q9BXF3 1484 aa39.36■■■■□ 3.89
GTPBP3-212ENST00000596125 NCAPD3P42695 1498 aa38.57■■■■□ 3.76
GTPBP3-212ENST00000596125 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP38.45■■■■□ 3.75
GTPBP3-212ENST00000596125 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa38.45■■■■□ 3.75
GTPBP3-212ENST00000596125 SMARCA4P51532 1647 aa38.45■■■■□ 3.75
GTPBP3-212ENST00000596125 SMARCA2P51531 1590 aa38.43■■■■□ 3.74
GTPBP3-212ENST00000596125 HMGXB3Q12766 1538 aa38.27■■■■□ 3.72
GTPBP3-212ENST00000596125 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa38.2■■■■□ 3.71
GTPBP3-212ENST00000596125 PEG3Q9GZU2 1588 aa38.15■■■■□ 3.7
GTPBP3-212ENST00000596125 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP38.12■■■■□ 3.69
GTPBP3-212ENST00000596125 MROH2BQ7Z745 1585 aa38.06■■■■□ 3.68
GTPBP3-212ENST00000596125 ERCC6Q03468 1493 aa37.78■■■■□ 3.64
GTPBP3-212ENST00000596125 CUX2O14529 1486 aa37.58■■■■□ 3.61
GTPBP3-212ENST00000596125 NESP48681 1621 aa37.58■■■■□ 3.61
GTPBP3-212ENST00000596125 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa37.56■■■■□ 3.6
GTPBP3-212ENST00000596125 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP37.56■■■■□ 3.6
GTPBP3-212ENST00000596125 WIZO95785 1651 aa37.56■■■■□ 3.6
GTPBP3-212ENST00000596125 PDS5BQ9NTI5 1447 aa37.45■■■■□ 3.59
GTPBP3-212ENST00000596125 CADPSQ9ULU8 1353 aa37.43■■■■□ 3.58
GTPBP3-212ENST00000596125 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP37.26■■■■□ 3.56
GTPBP3-212ENST00000596125 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP37.08■■■■□ 3.53
GTPBP3-212ENST00000596125 CFTRP13569 1480 aa37.07■■■■□ 3.52
GTPBP3-212ENST00000596125 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa37.03■■■■□ 3.52
GTPBP3-212ENST00000596125 MRC2Q9UBG0 1479 aa36.97■■■■□ 3.51
GTPBP3-212ENST00000596125 CEP164Q9UPV0 1460 aa36.94■■■■□ 3.5
GTPBP3-212ENST00000596125 FANCD2Q9BXW9 1451 aa36.93■■■■□ 3.5
GTPBP3-212ENST00000596125 CCDC88BA6NC98 1476 aa36.84■■■■□ 3.49
GTPBP3-212ENST00000596125 WDR62O43379 1518 aa36.81■■■■□ 3.48
GTPBP3-212ENST00000596125 PRDM2Q13029 1718 aa36.51■■■■□ 3.44
GTPBP3-212ENST00000596125 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP36.5■■■■□ 3.43
GTPBP3-212ENST00000596125 ABCC8Q09428 1581 aa36.41■■■■□ 3.42
GTPBP3-212ENST00000596125 TRIM41Q8WV44 630 aa36.34■■■■□ 3.41
GTPBP3-212ENST00000596125 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP36.3■■■■□ 3.4
GTPBP3-212ENST00000596125 TOPBP1Q92547 1522 aa36.24■■■■□ 3.39
GTPBP3-212ENST00000596125 IFT140Q96RY7 1462 aa36.24■■■■□ 3.39
GTPBP3-212ENST00000596125 DNMBPQ6XZF7 1577 aa36.16■■■■□ 3.38
GTPBP3-212ENST00000596125 OSCARQ8IYS5 282 aa36.05■■■■□ 3.36
GTPBP3-212ENST00000596125 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP35.95■■■■□ 3.35
GTPBP3-212ENST00000596125 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP35.91■■■■□ 3.34
GTPBP3-212ENST00000596125 SOGA1O94964 1423 aa35.85■■■■□ 3.33
GTPBP3-212ENST00000596125 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP35.82■■■■□ 3.32
GTPBP3-212ENST00000596125 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP35.76■■■■□ 3.329e-14■■■■■ 53.5
GTPBP3-212ENST00000596125 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP35.76■■■■□ 3.31
GTPBP3-212ENST00000596125 FGD5Q6ZNL6 1462 aa35.74■■■■□ 3.31
GTPBP3-212ENST00000596125 CUX1P39880 1505 aa35.74■■■■□ 3.31
GTPBP3-212ENST00000596125 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa35.72■■■■□ 3.31
GTPBP3-212ENST00000596125 WDR97A6NE52 1622 aa35.67■■■■□ 3.3
GTPBP3-212ENST00000596125 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP35.65■■■■□ 3.3
GTPBP3-212ENST00000596125 FBLN2P98095 1184 aa35.54■■■■□ 3.28
GTPBP3-212ENST00000596125 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP35.49■■■■□ 3.27
GTPBP3-212ENST00000596125 GRIN2BQ13224 1484 aa35.48■■■■□ 3.27
GTPBP3-212ENST00000596125 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa35.44■■■■□ 3.26
GTPBP3-212ENST00000596125 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP35.44■■■■□ 3.26
GTPBP3-212ENST00000596125 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP35.43■■■■□ 3.26
GTPBP3-212ENST00000596125 GAPVD1Q14C86 1478 aa35.4■■■■□ 3.26
GTPBP3-212ENST00000596125 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa35.39■■■■□ 3.26
GTPBP3-212ENST00000596125 TOP2BQ02880 1626 aa35.35■■■■□ 3.25
GTPBP3-212ENST00000596125 CHD1O14646 1710 aa35.31■■■■□ 3.24
GTPBP3-212ENST00000596125 SYNJ2O15056 1496 aa35.29■■■■□ 3.24
GTPBP3-212ENST00000596125 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa35.29■■■■□ 3.24
GTPBP3-212ENST00000596125 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa35.29■■■■□ 3.24
GTPBP3-212ENST00000596125 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa35.29■■■■□ 3.24
GTPBP3-212ENST00000596125 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa35.29■■■■□ 3.24
GTPBP3-212ENST00000596125 ARHGEF11O15085 1522 aa35.25■■■■□ 3.23
GTPBP3-212ENST00000596125 SYNJ1O43426 1573 aa35.22■■■■□ 3.23
GTPBP3-212ENST00000596125 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa35.21■■■■□ 3.23
GTPBP3-212ENST00000596125 PBRM1Q86U86 1689 aa35.13■■■■□ 3.21
GTPBP3-212ENST00000596125 CYB5RLQ6IPT4 315 aa35.07■■■■□ 3.2
GTPBP3-212ENST00000596125 CLASP1Q7Z460 1538 aa35.05■■■■□ 3.2
GTPBP3-212ENST00000596125 ERICH3Q5RHP9 1530 aa35.02■■■■□ 3.2
GTPBP3-212ENST00000596125 FHAD1B1AJZ9 1412 aa35.02■■■■□ 3.2
GTPBP3-212ENST00000596125 GRIN2AQ12879 1464 aa34.97■■■■□ 3.19
GTPBP3-212ENST00000596125 ADAMTS12P58397 1594 aa34.91■■■■□ 3.18
GTPBP3-212ENST00000596125 ARAP1Q96P48 1450 aa34.9■■■■□ 3.18
GTPBP3-212ENST00000596125 NUP160Q12769 1436 aa34.85■■■■□ 3.17
GTPBP3-212ENST00000596125 KIF27Q86VH2 1401 aa34.83■■■■□ 3.17
GTPBP3-212ENST00000596125 TRHP20396 242 aaPredicted RBP34.79■■■■□ 3.16
GTPBP3-212ENST00000596125 IGF1RP08069 1367 aa34.72■■■■□ 3.15
GTPBP3-212ENST00000596125 CEP170Q5SW79 1584 aa34.7■■■■□ 3.14
GTPBP3-212ENST00000596125 JPH4Q96JJ6 628 aa34.6■■■■□ 3.13
GTPBP3-212ENST00000596125 CUL7Q14999 1698 aa34.55■■■■□ 3.12
GTPBP3-212ENST00000596125 SHROOM2Q13796 1616 aa34.53■■■■□ 3.12
GTPBP3-212ENST00000596125 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa34.52■■■■□ 3.12
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