Protein–RNA interactions for Protein: Q13796

SHROOM2, Protein Shroom2, humanhuman

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Length 1,616 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHROOM2Q13796 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC40.95■■■■■ 4.15
SHROOM2Q13796 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC40.95■■■■■ 4.15
SHROOM2Q13796 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC40.95■■■■■ 4.15
SHROOM2Q13796 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.94■■■■■ 4.15
SHROOM2Q13796 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC40.94■■■■■ 4.14
SHROOM2Q13796 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.93■■■■■ 4.14
SHROOM2Q13796 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC40.93■■■■■ 4.14
SHROOM2Q13796 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.93■■■■■ 4.14
SHROOM2Q13796 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.92■■■■■ 4.14
SHROOM2Q13796 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC40.92■■■■■ 4.14
SHROOM2Q13796 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.91■■■■■ 4.14
SHROOM2Q13796 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC40.9■■■■■ 4.14
SHROOM2Q13796 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.9■■■■■ 4.14
SHROOM2Q13796 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC40.89■■■■■ 4.14
SHROOM2Q13796 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.89■■■■■ 4.14
SHROOM2Q13796 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.89■■■■■ 4.14
SHROOM2Q13796 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC40.89■■■■■ 4.14
SHROOM2Q13796 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.89■■■■■ 4.14
SHROOM2Q13796 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC40.89■■■■■ 4.14
SHROOM2Q13796 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC40.89■■■■■ 4.14
SHROOM2Q13796 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC40.88■■■■■ 4.13
SHROOM2Q13796 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC40.88■■■■■ 4.13
SHROOM2Q13796 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.88■■■■■ 4.13
SHROOM2Q13796 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC40.87■■■■■ 4.13
SHROOM2Q13796 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.87■■■■■ 4.13
SHROOM2Q13796 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC40.87■■■■■ 4.13
SHROOM2Q13796 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.86■■■■■ 4.13
SHROOM2Q13796 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC40.86■■■■■ 4.13
SHROOM2Q13796 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.86■■■■■ 4.13
SHROOM2Q13796 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC40.85■■■■■ 4.13
SHROOM2Q13796 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.85■■■■■ 4.13
SHROOM2Q13796 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.85■■■■■ 4.13
SHROOM2Q13796 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC40.85■■■■■ 4.13
SHROOM2Q13796 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.84■■■■■ 4.13
SHROOM2Q13796 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC40.83■■■■■ 4.13
SHROOM2Q13796 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC40.83■■■■■ 4.13
SHROOM2Q13796 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.83■■■■■ 4.13
SHROOM2Q13796 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.83■■■■■ 4.13
SHROOM2Q13796 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC40.83■■■■■ 4.13
SHROOM2Q13796 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.83■■■■■ 4.13
SHROOM2Q13796 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC40.82■■■■■ 4.13
SHROOM2Q13796 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC40.82■■■■■ 4.12
SHROOM2Q13796 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.81■■■■■ 4.12
SHROOM2Q13796 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC40.81■■■■■ 4.12
SHROOM2Q13796 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC40.81■■■■■ 4.12
SHROOM2Q13796 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC40.81■■■■■ 4.12
SHROOM2Q13796 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC40.8■■■■■ 4.12
SHROOM2Q13796 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC40.8■■■■■ 4.12
SHROOM2Q13796 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.8■■■■■ 4.12
SHROOM2Q13796 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC40.8■■■■■ 4.12
SHROOM2Q13796 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.79■■■■■ 4.12
SHROOM2Q13796 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC40.79■■■■■ 4.12
SHROOM2Q13796 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.79■■■■■ 4.12
SHROOM2Q13796 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC40.79■■■■■ 4.12
SHROOM2Q13796 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.78■■■■■ 4.12
SHROOM2Q13796 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.78■■■■■ 4.12
SHROOM2Q13796 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC40.78■■■■■ 4.12
SHROOM2Q13796 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC40.78■■■■■ 4.12
SHROOM2Q13796 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.78■■■■■ 4.12
SHROOM2Q13796 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC40.78■■■■■ 4.12
SHROOM2Q13796 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC40.77■■■■■ 4.12
SHROOM2Q13796 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC40.77■■■■■ 4.12
SHROOM2Q13796 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.77■■■■■ 4.12
SHROOM2Q13796 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.77■■■■■ 4.12
SHROOM2Q13796 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC40.76■■■■■ 4.12
SHROOM2Q13796 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.76■■■■■ 4.12
SHROOM2Q13796 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC40.76■■■■■ 4.12
SHROOM2Q13796 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC40.76■■■■■ 4.12
SHROOM2Q13796 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.76■■■■■ 4.12
SHROOM2Q13796 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.76■■■■■ 4.11
SHROOM2Q13796 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.75■■■■■ 4.11
SHROOM2Q13796 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC40.75■■■■■ 4.11
SHROOM2Q13796 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC40.75■■■■■ 4.11
SHROOM2Q13796 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.75■■■■■ 4.11
SHROOM2Q13796 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC40.74■■■■■ 4.11
SHROOM2Q13796 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC40.73■■■■■ 4.11
SHROOM2Q13796 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC40.73■■■■■ 4.11
SHROOM2Q13796 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC40.72■■■■■ 4.11
SHROOM2Q13796 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC40.71■■■■■ 4.11
SHROOM2Q13796 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.71■■■■■ 4.11
SHROOM2Q13796 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC40.71■■■■■ 4.11
SHROOM2Q13796 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.7■■■■■ 4.11
SHROOM2Q13796 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC40.7■■■■■ 4.11
SHROOM2Q13796 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC40.69■■■■■ 4.1
SHROOM2Q13796 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.69■■■■■ 4.1
SHROOM2Q13796 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC40.69■■■■■ 4.1
SHROOM2Q13796 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.68■■■■■ 4.1
SHROOM2Q13796 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC40.67■■■■■ 4.1
SHROOM2Q13796 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC40.66■■■■■ 4.1
SHROOM2Q13796 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC40.66■■■■■ 4.1
SHROOM2Q13796 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC40.66■■■■■ 4.1
SHROOM2Q13796 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC40.66■■■■■ 4.1
SHROOM2Q13796 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.65■■■■■ 4.1
SHROOM2Q13796 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC40.65■■■■■ 4.1
SHROOM2Q13796 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.65■■■■■ 4.1
SHROOM2Q13796 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.64■■■■■ 4.1
SHROOM2Q13796 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC40.64■■■■■ 4.1
SHROOM2Q13796 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.64■■■■■ 4.1
SHROOM2Q13796 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC40.64■■■■■ 4.1
SHROOM2Q13796 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC40.64■■■■■ 4.1
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