Protein–RNA interactions for Protein: Q12217

TY1A-BR, Transposon Ty1-BR Gag polyprotein, yeastyeast

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Length 440 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TY1A-BRQ12217 RSA1YPL193W 1146 nt8.45□□□□□ -1.06
TY1A-BRQ12217 AVT6YER119C 1347 nt8.45□□□□□ -1.06
TY1A-BRQ12217 NFI1YOR156C 2181 nt8.45□□□□□ -1.06
TY1A-BRQ12217 GID7YCL039W 2238 nt8.45□□□□□ -1.06
TY1A-BRQ12217 GLE1YDL207W 1617 nt8.44□□□□□ -1.06
TY1A-BRQ12217 SSN3YPL042C 1668 nt8.44□□□□□ -1.06
TY1A-BRQ12217 IST3YIR005W 447 nt8.44□□□□□ -1.06
TY1A-BRQ12217 ECM8YBR076W 1065 nt8.44□□□□□ -1.06
TY1A-BRQ12217 LDH1YBR204C 1128 nt8.44□□□□□ -1.06
TY1A-BRQ12217 SWC5YBR231C 912 nt8.44□□□□□ -1.06
TY1A-BRQ12217 SNU71YGR013W 1863 nt8.44□□□□□ -1.06
TY1A-BRQ12217 LDB17YDL146W 1476 nt8.44□□□□□ -1.06
TY1A-BRQ12217 SRG1SRG1 551 nt8.43□□□□□ -1.06
TY1A-BRQ12217 YJR084WYJR084W 1272 nt8.43□□□□□ -1.06
TY1A-BRQ12217 TIP41YPR040W 1071 nt8.43□□□□□ -1.06
TY1A-BRQ12217 PPT1YGR123C 1542 nt8.43□□□□□ -1.06
TY1A-BRQ12217 MIF2YKL089W 1650 nt8.43□□□□□ -1.06
TY1A-BRQ12217 DCV1YFR012W 609 nt8.42□□□□□ -1.06
TY1A-BRQ12217 YIR017W-AYIR017W-A 600 nt8.42□□□□□ -1.06
TY1A-BRQ12217 YJL067WYJL067W 351 nt8.42□□□□□ -1.06
TY1A-BRQ12217 YUR1YJL139C 1287 nt8.42□□□□□ -1.06
TY1A-BRQ12217 DRE2YKR071C 1047 nt8.42□□□□□ -1.06
TY1A-BRQ12217 PSR2YLR019W 1194 nt8.42□□□□□ -1.06
TY1A-BRQ12217 REH1YLR387C 1299 nt8.42□□□□□ -1.06
TY1A-BRQ12217 BSC4YNL269W 396 nt8.42□□□□□ -1.06
TY1A-BRQ12217 GOR1YNL274C 1053 nt8.42□□□□□ -1.06
TY1A-BRQ12217 RPN5YDL147W 1338 nt8.42□□□□□ -1.06
TY1A-BRQ12217 UGP1YKL035W 1500 nt8.41□□□□□ -1.06
TY1A-BRQ12217 KCH1YJR054W 1494 nt8.41□□□□□ -1.06
TY1A-BRQ12217 SDS3YIL084C 984 nt8.41□□□□□ -1.06
TY1A-BRQ12217 IPP1YBR011C 864 nt8.41□□□□□ -1.06
TY1A-BRQ12217 TED1YIL039W 1422 nt8.4□□□□□ -1.06
TY1A-BRQ12217 NHP10YDL002C 612 nt8.4□□□□□ -1.06
TY1A-BRQ12217 USB1YLR132C 873 nt8.4□□□□□ -1.06
TY1A-BRQ12217 YLR456WYLR456W 615 nt8.4□□□□□ -1.06
TY1A-BRQ12217 INP54YOL065C 1155 nt8.4□□□□□ -1.06
TY1A-BRQ12217 SMK1YPR054W 1167 nt8.4□□□□□ -1.06
TY1A-BRQ12217 YSA1YBR111C 696 nt8.4□□□□□ -1.06
TY1A-BRQ12217 CNS1YBR155W 1158 nt8.4□□□□□ -1.06
TY1A-BRQ12217 MMR1YLR190W 1476 nt8.39□□□□□ -1.07
TY1A-BRQ12217 HSE1YHL002W 1359 nt8.39□□□□□ -1.07
TY1A-BRQ12217 RTT103YDR289C 1230 nt8.39□□□□□ -1.07
TY1A-BRQ12217 SCL1YGL011C 759 nt8.39□□□□□ -1.07
TY1A-BRQ12217 YNG2YHR090C 849 nt8.39□□□□□ -1.07
TY1A-BRQ12217 AHT1YHR093W 549 nt8.39□□□□□ -1.07
TY1A-BRQ12217 PRI1YIR008C 1230 nt8.39□□□□□ -1.07
TY1A-BRQ12217 VPS75YNL246W 795 nt8.39□□□□□ -1.07
TY1A-BRQ12217 YOR105WYOR105W 327 nt8.39□□□□□ -1.07
TY1A-BRQ12217 SPP1YPL138C 1062 nt8.39□□□□□ -1.07
TY1A-BRQ12217 DAP1YPL170W 459 nt8.39□□□□□ -1.07
TY1A-BRQ12217 HAL1YPR005C 885 nt8.39□□□□□ -1.07
TY1A-BRQ12217 SCD6YPR129W 1050 nt8.39□□□□□ -1.07
TY1A-BRQ12217 YDL027CYDL027C 1263 nt8.38□□□□□ -1.07
TY1A-BRQ12217 YGR026WYGR026W 837 nt8.38□□□□□ -1.07
TY1A-BRQ12217 YLL017WYLL017W 312 nt8.38□□□□□ -1.07
TY1A-BRQ12217 YLR162WYLR162W 357 nt8.38□□□□□ -1.07
TY1A-BRQ12217 YNL024CYNL024C 741 nt8.38□□□□□ -1.07
TY1A-BRQ12217 YHL008CYHL008C 1884 nt8.38□□□□□ -1.07
TY1A-BRQ12217 ZRT3YKL175W 1512 nt8.38□□□□□ -1.07
TY1A-BRQ12217 ILV3YJR016C 1758 nt8.38□□□□□ -1.07
TY1A-BRQ12217 URA8YJR103W 1737 nt8.37□□□□□ -1.07
TY1A-BRQ12217 TFC7YOR110W 1308 nt8.37□□□□□ -1.07
TY1A-BRQ12217 MNN10YDR245W 1182 nt8.37□□□□□ -1.07
TY1A-BRQ12217 YGL185CYGL185C 1140 nt8.37□□□□□ -1.07
TY1A-BRQ12217 YLF2YHL014C 1218 nt8.37□□□□□ -1.07
TY1A-BRQ12217 INP1YMR204C 1263 nt8.37□□□□□ -1.07
TY1A-BRQ12217 SMA1YPL027W 738 nt8.37□□□□□ -1.07
TY1A-BRQ12217 USV1YPL230W 1176 nt8.37□□□□□ -1.07
TY1A-BRQ12217 ADE17YMR120C 1779 nt8.37□□□□□ -1.07
TY1A-BRQ12217 YLR345WYLR345W 1530 nt8.36□□□□□ -1.07
TY1A-BRQ12217 PET18YCR020C 648 nt8.36□□□□□ -1.07
TY1A-BRQ12217 ATC1YDR184C 885 nt8.36□□□□□ -1.07
TY1A-BRQ12217 NUC1YJL208C 990 nt8.36□□□□□ -1.07
TY1A-BRQ12217 HAM1YJR069C 594 nt8.36□□□□□ -1.07
TY1A-BRQ12217 YMR245WYMR245W 621 nt8.36□□□□□ -1.07
TY1A-BRQ12217 PHO23YNL097C 993 nt8.36□□□□□ -1.07
TY1A-BRQ12217 ARG8YOL140W 1272 nt8.36□□□□□ -1.07
TY1A-BRQ12217 YPR064WYPR064W 420 nt8.36□□□□□ -1.07
TY1A-BRQ12217 YEF1YEL041W 1488 nt8.36□□□□□ -1.07
TY1A-BRQ12217 PRE1YER012W 597 nt8.35□□□□□ -1.07
TY1A-BRQ12217 RSM26YJR101W 801 nt8.35□□□□□ -1.07
TY1A-BRQ12217 YKL030WYKL030W 606 nt8.35□□□□□ -1.07
TY1A-BRQ12217 SEC72YLR292C 582 nt8.35□□□□□ -1.07
TY1A-BRQ12217 SPO20YMR017W 1194 nt8.35□□□□□ -1.07
TY1A-BRQ12217 PRP46YPL151C 1356 nt8.35□□□□□ -1.07
TY1A-BRQ12217 KTR4YBR199W 1395 nt8.35□□□□□ -1.07
TY1A-BRQ12217 IMG2YCR071C 441 nt8.34□□□□□ -1.07
TY1A-BRQ12217 IPI1YHR085W 1005 nt8.34□□□□□ -1.07
TY1A-BRQ12217 ELF1YKL160W 438 nt8.34□□□□□ -1.07
TY1A-BRQ12217 YMR178WYMR178W 825 nt8.34□□□□□ -1.07
TY1A-BRQ12217 REX4YOL080C 870 nt8.34□□□□□ -1.07
TY1A-BRQ12217 SFG1YOR315W 1041 nt8.34□□□□□ -1.07
TY1A-BRQ12217 SNF8YPL002C 702 nt8.34□□□□□ -1.07
TY1A-BRQ12217 UTR1YJR049C 1593 nt8.34□□□□□ -1.07
TY1A-BRQ12217 ARH1YDR376W 1482 nt8.33□□□□□ -1.08
TY1A-BRQ12217 YHB1YGR234W 1200 nt8.33□□□□□ -1.08
TY1A-BRQ12217 PAN5YHR063C 1140 nt8.33□□□□□ -1.08
TY1A-BRQ12217 GTT1YIR038C 705 nt8.33□□□□□ -1.08
TY1A-BRQ12217 POL32YJR043C 1053 nt8.33□□□□□ -1.08
TY1A-BRQ12217 MGM101YJR144W 810 nt8.33□□□□□ -1.08
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