Protein–RNA interactions for Protein: Q08722

CD47, Leukocyte surface antigen CD47, humanhuman

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD47Q08722 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CD47Q08722 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
CD47Q08722 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CD47Q08722 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CD47Q08722 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CD47Q08722 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CD47Q08722 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CD47Q08722 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CD47Q08722 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CD47Q08722 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CD47Q08722 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CD47Q08722 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CD47Q08722 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CD47Q08722 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CD47Q08722 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CD47Q08722 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CD47Q08722 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CD47Q08722 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CD47Q08722 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CD47Q08722 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CD47Q08722 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CD47Q08722 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CD47Q08722 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CD47Q08722 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CD47Q08722 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CD47Q08722 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CD47Q08722 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CD47Q08722 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CD47Q08722 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CD47Q08722 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CD47Q08722 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CD47Q08722 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CD47Q08722 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CD47Q08722 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CD47Q08722 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CD47Q08722 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CD47Q08722 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CD47Q08722 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CD47Q08722 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CD47Q08722 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CD47Q08722 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CD47Q08722 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CD47Q08722 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CD47Q08722 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CD47Q08722 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CD47Q08722 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CD47Q08722 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CD47Q08722 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CD47Q08722 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CD47Q08722 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CD47Q08722 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CD47Q08722 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CD47Q08722 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CD47Q08722 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CD47Q08722 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CD47Q08722 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CD47Q08722 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CD47Q08722 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CD47Q08722 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CD47Q08722 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CD47Q08722 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CD47Q08722 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CD47Q08722 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CD47Q08722 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CD47Q08722 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CD47Q08722 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CD47Q08722 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CD47Q08722 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CD47Q08722 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CD47Q08722 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CD47Q08722 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CD47Q08722 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CD47Q08722 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CD47Q08722 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CD47Q08722 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CD47Q08722 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CD47Q08722 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CD47Q08722 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CD47Q08722 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CD47Q08722 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CD47Q08722 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CD47Q08722 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CD47Q08722 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CD47Q08722 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CD47Q08722 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CD47Q08722 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CD47Q08722 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CD47Q08722 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CD47Q08722 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CD47Q08722 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CD47Q08722 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CD47Q08722 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CD47Q08722 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CD47Q08722 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CD47Q08722 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CD47Q08722 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CD47Q08722 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CD47Q08722 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CD47Q08722 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CD47Q08722 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.2 ms