Protein–RNA interactions for Protein: P53985

SLC16A1, Monocarboxylate transporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC16A1P53985 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC16A1P53985 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC16A1P53985 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC16A1P53985 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC16A1P53985 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC16A1P53985 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC16A1P53985 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC16A1P53985 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC16A1P53985 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC16A1P53985 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC16A1P53985 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC16A1P53985 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC16A1P53985 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC16A1P53985 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC16A1P53985 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC16A1P53985 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC16A1P53985 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC16A1P53985 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC16A1P53985 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC16A1P53985 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
SLC16A1P53985 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC16A1P53985 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC16A1P53985 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC16A1P53985 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC16A1P53985 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC16A1P53985 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC16A1P53985 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC16A1P53985 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC16A1P53985 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC16A1P53985 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC16A1P53985 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC16A1P53985 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC16A1P53985 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC16A1P53985 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC16A1P53985 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC16A1P53985 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC16A1P53985 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC16A1P53985 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC16A1P53985 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC16A1P53985 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC16A1P53985 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC16A1P53985 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC16A1P53985 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC16A1P53985 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC16A1P53985 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC16A1P53985 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC16A1P53985 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC16A1P53985 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC16A1P53985 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC16A1P53985 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC16A1P53985 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC16A1P53985 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC16A1P53985 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC16A1P53985 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC16A1P53985 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC16A1P53985 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
SLC16A1P53985 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC16A1P53985 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC16A1P53985 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC16A1P53985 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC16A1P53985 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC16A1P53985 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC16A1P53985 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC16A1P53985 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC16A1P53985 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC16A1P53985 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC16A1P53985 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC16A1P53985 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC16A1P53985 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC16A1P53985 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC16A1P53985 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC16A1P53985 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC16A1P53985 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC16A1P53985 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC16A1P53985 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC16A1P53985 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC16A1P53985 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC16A1P53985 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC16A1P53985 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC16A1P53985 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC16A1P53985 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC16A1P53985 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC16A1P53985 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC16A1P53985 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC16A1P53985 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC16A1P53985 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC16A1P53985 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC16A1P53985 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC16A1P53985 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC16A1P53985 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC16A1P53985 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SLC16A1P53985 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC16A1P53985 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC16A1P53985 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC16A1P53985 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC16A1P53985 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC16A1P53985 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC16A1P53985 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC16A1P53985 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC16A1P53985 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms