Protein–RNA interactions for Protein: P49454

CENPF, Centromere protein F, humanhuman

Predictions only

Length 3,210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPFP49454 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CENPFP49454 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CENPFP49454 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CENPFP49454 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CENPFP49454 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
CENPFP49454 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CENPFP49454 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CENPFP49454 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CENPFP49454 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CENPFP49454 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
CENPFP49454 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CENPFP49454 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
CENPFP49454 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
CENPFP49454 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CENPFP49454 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
CENPFP49454 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CENPFP49454 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
CENPFP49454 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
CENPFP49454 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CENPFP49454 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
CENPFP49454 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
CENPFP49454 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CENPFP49454 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CENPFP49454 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CENPFP49454 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.19
CENPFP49454 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
CENPFP49454 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
CENPFP49454 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
CENPFP49454 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CENPFP49454 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CENPFP49454 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CENPFP49454 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CENPFP49454 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CENPFP49454 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CENPFP49454 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CENPFP49454 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CENPFP49454 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CENPFP49454 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CENPFP49454 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CENPFP49454 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CENPFP49454 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CENPFP49454 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CENPFP49454 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CENPFP49454 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CENPFP49454 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
CENPFP49454 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CENPFP49454 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
CENPFP49454 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.64■■■□□ 2.18
CENPFP49454 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
CENPFP49454 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC28.64■■■□□ 2.18
CENPFP49454 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CENPFP49454 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CENPFP49454 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
CENPFP49454 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CENPFP49454 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
CENPFP49454 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CENPFP49454 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CENPFP49454 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CENPFP49454 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CENPFP49454 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CENPFP49454 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CENPFP49454 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CENPFP49454 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CENPFP49454 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CENPFP49454 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CENPFP49454 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CENPFP49454 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CENPFP49454 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CENPFP49454 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CENPFP49454 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CENPFP49454 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CENPFP49454 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CENPFP49454 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CENPFP49454 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CENPFP49454 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CENPFP49454 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CENPFP49454 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CENPFP49454 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
CENPFP49454 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CENPFP49454 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CENPFP49454 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CENPFP49454 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
CENPFP49454 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CENPFP49454 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CENPFP49454 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CENPFP49454 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CENPFP49454 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CENPFP49454 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CENPFP49454 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CENPFP49454 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CENPFP49454 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CENPFP49454 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CENPFP49454 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CENPFP49454 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CENPFP49454 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CENPFP49454 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CENPFP49454 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CENPFP49454 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CENPFP49454 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
CENPFP49454 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms