Protein–RNA interactions for Protein: P40509

SEC28, Coatomer subunit epsilon, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 296 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SEC28P40509 RBS1YDL189W 1374 nt7.2□□□□□ -1.26
SEC28P40509 YER137CYER137C 447 nt7.2□□□□□ -1.26
SEC28P40509 RMD8YFR048W 1989 nt7.2□□□□□ -1.26
SEC28P40509 ADE17YMR120C 1779 nt7.2□□□□□ -1.26
SEC28P40509 PET117YER058W 324 nt7.19□□□□□ -1.26
SEC28P40509 ATG22YCL038C 1587 nt7.19□□□□□ -1.26
SEC28P40509 PRB1YEL060C 1908 nt7.19□□□□□ -1.26
SEC28P40509 PRP2YNR011C 2631 nt7.18□□□□□ -1.26
SEC28P40509 CDC13YDL220C 2775 nt7.18□□□□□ -1.26
SEC28P40509 SUF3tG(CCC)D 72 nt7.18□□□□□ -1.26
SEC28P40509 DOC1YGL240W 753 nt7.18□□□□□ -1.26
SEC28P40509 POB3YML069W 1659 nt7.18□□□□□ -1.26
SEC28P40509 FLC2YAL053W 2352 nt7.18□□□□□ -1.26
SEC28P40509 YKR018CYKR018C 2178 nt7.18□□□□□ -1.26
SEC28P40509 YML122CYML122C 381 nt7.17□□□□□ -1.26
SEC28P40509 IDP3YNL009W 1263 nt7.17□□□□□ -1.26
SEC28P40509 SDH8YBR269C 417 nt7.17□□□□□ -1.26
SEC28P40509 TOS2YGR221C 1869 nt7.17□□□□□ -1.26
SEC28P40509 CDC7YDL017W 1524 nt7.16□□□□□ -1.26
SEC28P40509 RPL43AYPR043W 279 nt7.15□□□□□ -1.26
SEC28P40509 CIT2YCR005C 1383 nt7.15□□□□□ -1.26
SEC28P40509 HSM3YBR272C 1443 nt7.15□□□□□ -1.27
SEC28P40509 NUP57YGR119C 1626 nt7.15□□□□□ -1.27
SEC28P40509 RDR1YOR380W 1641 nt7.15□□□□□ -1.27
SEC28P40509 FCY2YER056C 1602 nt7.14□□□□□ -1.27
SEC28P40509 ATO2YNR002C 849 nt7.14□□□□□ -1.27
SEC28P40509 TOD6YBL054W 1578 nt7.13□□□□□ -1.27
SEC28P40509 YIP4YGL198W 708 nt7.13□□□□□ -1.27
SEC28P40509 YMR074CYMR074C 438 nt7.13□□□□□ -1.27
SEC28P40509 EHD3YDR036C 1503 nt7.12□□□□□ -1.27
SEC28P40509 TUB1YML085C 1344 nt7.12□□□□□ -1.27
SEC28P40509 GFA1YKL104C 2154 nt7.12□□□□□ -1.27
SEC28P40509 CIT3YPR001W 1461 nt7.11□□□□□ -1.27
SEC28P40509 AQR1YNL065W 1761 nt7.11□□□□□ -1.27
SEC28P40509 YCR041WYCR041W 333 nt7.11□□□□□ -1.27
SEC28P40509 AIM2YAL049C 741 nt7.11□□□□□ -1.27
SEC28P40509 ATP23YNR020C 813 nt7.11□□□□□ -1.27
SEC28P40509 DPM1YPR183W 804 nt7.11□□□□□ -1.27
SEC28P40509 SEC24YIL109C 2781 nt7.11□□□□□ -1.27
SEC28P40509 YPQ2YDR352W 954 nt7.1□□□□□ -1.27
SEC28P40509 SNF4YGL115W 969 nt7.1□□□□□ -1.27
SEC28P40509 EXG2YDR261C 1689 nt7.09□□□□□ -1.27
SEC28P40509 LOT6YLR011W 576 nt7.09□□□□□ -1.27
SEC28P40509 YNR001W-AYNR001W-A 219 nt7.09□□□□□ -1.27
SEC28P40509 PGI1YBR196C 1665 nt7.09□□□□□ -1.27
SEC28P40509 DML1YMR211W 1428 nt7.09□□□□□ -1.28
SEC28P40509 BNA3YJL060W 1335 nt7.08□□□□□ -1.28
SEC28P40509 MPE1YKL059C 1326 nt7.08□□□□□ -1.28
SEC28P40509 EDC2YER035W 438 nt7.08□□□□□ -1.28
SEC28P40509 SHO1YER118C 1104 nt7.08□□□□□ -1.28
SEC28P40509 SUN4YNL066W 1263 nt7.08□□□□□ -1.28
SEC28P40509 ENB1YOL158C 1821 nt7.08□□□□□ -1.28
SEC28P40509 YBL111CYBL111C 2004 nt7.08□□□□□ -1.28
SEC28P40509 MHP1YJL042W 4197 nt7.08□□□□□ -1.28
SEC28P40509 FCP1YMR277W 2199 nt7.08□□□□□ -1.28
SEC28P40509 TRR2YHR106W 1029 nt7.07□□□□□ -1.28
SEC28P40509 YML079WYML079W 606 nt7.07□□□□□ -1.28
SEC28P40509 NFS1YCL017C 1494 nt7.06□□□□□ -1.28
SEC28P40509 ERG27YLR100W 1044 nt7.06□□□□□ -1.28
SEC28P40509 PIH1YHR034C 1035 nt7.05□□□□□ -1.28
SEC28P40509 THR1YHR025W 1074 nt7.04□□□□□ -1.28
SEC28P40509 YLR112WYLR112W 420 nt7.04□□□□□ -1.28
SEC28P40509 RFS1YBR052C 633 nt7.04□□□□□ -1.28
SEC28P40509 YPR127WYPR127W 1038 nt7.04□□□□□ -1.28
SEC28P40509 YBR226CYBR226C 411 nt7.04□□□□□ -1.28
SEC28P40509 SGE1YPR198W 1632 nt7.03□□□□□ -1.28
SEC28P40509 PTH2YBL057C 627 nt7.03□□□□□ -1.28
SEC28P40509 PRS4YBL068W 981 nt7.03□□□□□ -1.28
SEC28P40509 RTC4YNL254C 1206 nt7.03□□□□□ -1.28
SEC28P40509 PHO85YPL031C 918 nt7.02□□□□□ -1.29
SEC28P40509 YPL067CYPL067C 597 nt7.02□□□□□ -1.29
SEC28P40509 MAK32YCR019W 1092 nt7.01□□□□□ -1.29
SEC28P40509 DMC1YER179W 1005 nt7.01□□□□□ -1.29
SEC28P40509 GET4YOR164C 939 nt7.01□□□□□ -1.29
SEC28P40509 GPA1YHR005C 1419 nt7.01□□□□□ -1.29
SEC28P40509 HGH1YGR187C 1185 nt7□□□□□ -1.29
SEC28P40509 ACO1YLR304C 2337 nt7□□□□□ -1.29
SEC28P40509 DLD1YDL174C 1764 nt7□□□□□ -1.29
SEC28P40509 YAL019W-AYAL019W-A 570 nt6.99□□□□□ -1.29
SEC28P40509 YOR012WYOR012W 414 nt6.99□□□□□ -1.29
SEC28P40509 SNT309YPR101W 528 nt6.99□□□□□ -1.29
SEC28P40509 RGT2YDL138W 2292 nt6.99□□□□□ -1.29
SEC28P40509 DAL4YIR028W 1908 nt6.99□□□□□ -1.29
SEC28P40509 CDC16YKL022C 2523 nt6.98□□□□□ -1.29
SEC28P40509 IRC5YFR038W 2562 nt6.98□□□□□ -1.29
SEC28P40509 EDC3YEL015W 1656 nt6.98□□□□□ -1.29
SEC28P40509 YCR049CYCR049C 447 nt6.98□□□□□ -1.29
SEC28P40509 MTR3YGR158C 753 nt6.98□□□□□ -1.29
SEC28P40509 MIX17YMR002W 471 nt6.98□□□□□ -1.29
SEC28P40509 PRE5YMR314W 705 nt6.98□□□□□ -1.29
SEC28P40509 YOR268CYOR268C 399 nt6.98□□□□□ -1.29
SEC28P40509 ATP4YPL078C 735 nt6.98□□□□□ -1.29
SEC28P40509 YPR130CYPR130C 408 nt6.98□□□□□ -1.29
SEC28P40509 UME1YPL139C 1383 nt6.97□□□□□ -1.29
SEC28P40509 PLB2YMR006C 2121 nt6.97□□□□□ -1.29
SEC28P40509 HPT1YDR399W 666 nt6.97□□□□□ -1.29
SEC28P40509 FAF1YIL019W 1041 nt6.97□□□□□ -1.29
SEC28P40509 YNL017CYNL017C 339 nt6.97□□□□□ -1.29
SEC28P40509 YPQ1YOL092W 927 nt6.97□□□□□ -1.29
SEC28P40509 TDP1YBR223C 1635 nt6.97□□□□□ -1.29
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