Protein–RNA interactions for Protein: P31644

GABRA5, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-5, humanhuman

Predictions only

Length 462 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA5P31644 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GABRA5P31644 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GABRA5P31644 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GABRA5P31644 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GABRA5P31644 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GABRA5P31644 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GABRA5P31644 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GABRA5P31644 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GABRA5P31644 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GABRA5P31644 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GABRA5P31644 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GABRA5P31644 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GABRA5P31644 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
GABRA5P31644 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GABRA5P31644 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GABRA5P31644 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GABRA5P31644 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GABRA5P31644 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GABRA5P31644 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GABRA5P31644 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GABRA5P31644 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GABRA5P31644 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GABRA5P31644 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GABRA5P31644 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GABRA5P31644 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GABRA5P31644 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GABRA5P31644 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GABRA5P31644 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GABRA5P31644 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GABRA5P31644 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GABRA5P31644 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GABRA5P31644 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GABRA5P31644 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GABRA5P31644 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GABRA5P31644 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GABRA5P31644 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GABRA5P31644 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GABRA5P31644 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GABRA5P31644 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GABRA5P31644 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GABRA5P31644 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GABRA5P31644 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GABRA5P31644 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GABRA5P31644 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GABRA5P31644 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GABRA5P31644 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GABRA5P31644 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GABRA5P31644 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC22■■□□□ 1.11
GABRA5P31644 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GABRA5P31644 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GABRA5P31644 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GABRA5P31644 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GABRA5P31644 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GABRA5P31644 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GABRA5P31644 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GABRA5P31644 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GABRA5P31644 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GABRA5P31644 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
GABRA5P31644 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GABRA5P31644 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
GABRA5P31644 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
GABRA5P31644 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GABRA5P31644 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GABRA5P31644 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GABRA5P31644 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
GABRA5P31644 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GABRA5P31644 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GABRA5P31644 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GABRA5P31644 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GABRA5P31644 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GABRA5P31644 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GABRA5P31644 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GABRA5P31644 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GABRA5P31644 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GABRA5P31644 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GABRA5P31644 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
GABRA5P31644 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GABRA5P31644 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GABRA5P31644 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GABRA5P31644 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GABRA5P31644 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GABRA5P31644 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GABRA5P31644 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GABRA5P31644 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GABRA5P31644 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GABRA5P31644 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GABRA5P31644 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GABRA5P31644 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GABRA5P31644 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GABRA5P31644 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GABRA5P31644 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GABRA5P31644 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GABRA5P31644 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GABRA5P31644 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
GABRA5P31644 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GABRA5P31644 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
GABRA5P31644 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GABRA5P31644 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GABRA5P31644 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
GABRA5P31644 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms