Protein–RNA interactions for Protein: P15976

GATA1, Erythroid transcription factor, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATA1P15976 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GATA1P15976 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
GATA1P15976 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GATA1P15976 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GATA1P15976 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
GATA1P15976 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GATA1P15976 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GATA1P15976 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GATA1P15976 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GATA1P15976 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GATA1P15976 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GATA1P15976 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GATA1P15976 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GATA1P15976 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GATA1P15976 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GATA1P15976 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GATA1P15976 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GATA1P15976 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GATA1P15976 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GATA1P15976 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GATA1P15976 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
GATA1P15976 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GATA1P15976 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GATA1P15976 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
GATA1P15976 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GATA1P15976 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GATA1P15976 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GATA1P15976 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GATA1P15976 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GATA1P15976 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GATA1P15976 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
GATA1P15976 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GATA1P15976 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GATA1P15976 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GATA1P15976 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GATA1P15976 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GATA1P15976 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GATA1P15976 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GATA1P15976 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GATA1P15976 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GATA1P15976 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GATA1P15976 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GATA1P15976 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GATA1P15976 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GATA1P15976 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GATA1P15976 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GATA1P15976 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GATA1P15976 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GATA1P15976 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GATA1P15976 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GATA1P15976 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GATA1P15976 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GATA1P15976 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GATA1P15976 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GATA1P15976 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GATA1P15976 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GATA1P15976 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GATA1P15976 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GATA1P15976 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
GATA1P15976 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GATA1P15976 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GATA1P15976 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GATA1P15976 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
GATA1P15976 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
GATA1P15976 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
GATA1P15976 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
GATA1P15976 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
GATA1P15976 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GATA1P15976 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GATA1P15976 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GATA1P15976 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GATA1P15976 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
GATA1P15976 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GATA1P15976 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GATA1P15976 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GATA1P15976 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GATA1P15976 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GATA1P15976 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GATA1P15976 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GATA1P15976 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GATA1P15976 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GATA1P15976 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GATA1P15976 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GATA1P15976 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GATA1P15976 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
GATA1P15976 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GATA1P15976 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GATA1P15976 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GATA1P15976 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GATA1P15976 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GATA1P15976 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GATA1P15976 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GATA1P15976 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GATA1P15976 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GATA1P15976 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GATA1P15976 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GATA1P15976 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GATA1P15976 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GATA1P15976 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
GATA1P15976 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.5 ms