Protein–RNA interactions for Protein: P08F94

PKHD1, Fibrocystin, humanhuman

Predictions only

Length 4,074 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKHD1P08F94 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PKHD1P08F94 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PKHD1P08F94 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PKHD1P08F94 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PKHD1P08F94 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PKHD1P08F94 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
PKHD1P08F94 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PKHD1P08F94 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PKHD1P08F94 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PKHD1P08F94 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PKHD1P08F94 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PKHD1P08F94 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PKHD1P08F94 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PKHD1P08F94 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PKHD1P08F94 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PKHD1P08F94 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PKHD1P08F94 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
PKHD1P08F94 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PKHD1P08F94 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PKHD1P08F94 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
PKHD1P08F94 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PKHD1P08F94 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PKHD1P08F94 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PKHD1P08F94 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PKHD1P08F94 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PKHD1P08F94 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PKHD1P08F94 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PKHD1P08F94 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PKHD1P08F94 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PKHD1P08F94 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
PKHD1P08F94 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PKHD1P08F94 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
PKHD1P08F94 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PKHD1P08F94 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PKHD1P08F94 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PKHD1P08F94 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PKHD1P08F94 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PKHD1P08F94 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PKHD1P08F94 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PKHD1P08F94 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PKHD1P08F94 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PKHD1P08F94 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PKHD1P08F94 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PKHD1P08F94 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PKHD1P08F94 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PKHD1P08F94 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PKHD1P08F94 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PKHD1P08F94 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PKHD1P08F94 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PKHD1P08F94 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PKHD1P08F94 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
PKHD1P08F94 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PKHD1P08F94 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PKHD1P08F94 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PKHD1P08F94 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PKHD1P08F94 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PKHD1P08F94 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PKHD1P08F94 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PKHD1P08F94 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PKHD1P08F94 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PKHD1P08F94 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PKHD1P08F94 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PKHD1P08F94 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PKHD1P08F94 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PKHD1P08F94 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PKHD1P08F94 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PKHD1P08F94 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PKHD1P08F94 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
PKHD1P08F94 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PKHD1P08F94 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
PKHD1P08F94 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
PKHD1P08F94 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PKHD1P08F94 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
PKHD1P08F94 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PKHD1P08F94 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
PKHD1P08F94 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
PKHD1P08F94 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PKHD1P08F94 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PKHD1P08F94 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PKHD1P08F94 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PKHD1P08F94 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PKHD1P08F94 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PKHD1P08F94 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PKHD1P08F94 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PKHD1P08F94 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PKHD1P08F94 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PKHD1P08F94 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PKHD1P08F94 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PKHD1P08F94 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PKHD1P08F94 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PKHD1P08F94 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
PKHD1P08F94 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PKHD1P08F94 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PKHD1P08F94 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PKHD1P08F94 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PKHD1P08F94 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PKHD1P08F94 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PKHD1P08F94 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PKHD1P08F94 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PKHD1P08F94 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.1 ms