Protein–RNA interactions for Protein: O95988

TCL1B, T-cell leukemia/lymphoma protein 1B, humanhuman

Predictions only

Length 128 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCL1BO95988 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TCL1BO95988 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TCL1BO95988 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
TCL1BO95988 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TCL1BO95988 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
TCL1BO95988 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TCL1BO95988 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TCL1BO95988 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TCL1BO95988 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
TCL1BO95988 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TCL1BO95988 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TCL1BO95988 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TCL1BO95988 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TCL1BO95988 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TCL1BO95988 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TCL1BO95988 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TCL1BO95988 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TCL1BO95988 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TCL1BO95988 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TCL1BO95988 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TCL1BO95988 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TCL1BO95988 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TCL1BO95988 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TCL1BO95988 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TCL1BO95988 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TCL1BO95988 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TCL1BO95988 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TCL1BO95988 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TCL1BO95988 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TCL1BO95988 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TCL1BO95988 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TCL1BO95988 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TCL1BO95988 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TCL1BO95988 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TCL1BO95988 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TCL1BO95988 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TCL1BO95988 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TCL1BO95988 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TCL1BO95988 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TCL1BO95988 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TCL1BO95988 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TCL1BO95988 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TCL1BO95988 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TCL1BO95988 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TCL1BO95988 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TCL1BO95988 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TCL1BO95988 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TCL1BO95988 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TCL1BO95988 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
TCL1BO95988 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TCL1BO95988 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TCL1BO95988 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TCL1BO95988 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TCL1BO95988 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TCL1BO95988 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TCL1BO95988 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TCL1BO95988 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TCL1BO95988 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TCL1BO95988 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TCL1BO95988 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TCL1BO95988 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TCL1BO95988 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TCL1BO95988 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TCL1BO95988 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TCL1BO95988 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TCL1BO95988 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TCL1BO95988 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TCL1BO95988 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TCL1BO95988 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TCL1BO95988 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TCL1BO95988 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TCL1BO95988 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TCL1BO95988 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TCL1BO95988 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TCL1BO95988 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TCL1BO95988 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TCL1BO95988 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TCL1BO95988 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TCL1BO95988 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TCL1BO95988 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TCL1BO95988 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TCL1BO95988 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TCL1BO95988 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TCL1BO95988 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TCL1BO95988 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TCL1BO95988 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TCL1BO95988 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TCL1BO95988 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TCL1BO95988 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TCL1BO95988 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TCL1BO95988 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TCL1BO95988 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TCL1BO95988 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TCL1BO95988 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TCL1BO95988 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TCL1BO95988 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TCL1BO95988 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TCL1BO95988 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TCL1BO95988 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TCL1BO95988 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms