Protein–RNA interactions for Protein: O95613

PCNT, Pericentrin, humanhuman

Predictions only

Length 3,336 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCNTO95613 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
PCNTO95613 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
PCNTO95613 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
PCNTO95613 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
PCNTO95613 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
PCNTO95613 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
PCNTO95613 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
PCNTO95613 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
PCNTO95613 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
PCNTO95613 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
PCNTO95613 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
PCNTO95613 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
PCNTO95613 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
PCNTO95613 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
PCNTO95613 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
PCNTO95613 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
PCNTO95613 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
PCNTO95613 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
PCNTO95613 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
PCNTO95613 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
PCNTO95613 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
PCNTO95613 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
PCNTO95613 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
PCNTO95613 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
PCNTO95613 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
PCNTO95613 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
PCNTO95613 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
PCNTO95613 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
PCNTO95613 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
PCNTO95613 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
PCNTO95613 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
PCNTO95613 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
PCNTO95613 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC29.74■■■□□ 2.35
PCNTO95613 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
PCNTO95613 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
PCNTO95613 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
PCNTO95613 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
PCNTO95613 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
PCNTO95613 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
PCNTO95613 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
PCNTO95613 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
PCNTO95613 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
PCNTO95613 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
PCNTO95613 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
PCNTO95613 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
PCNTO95613 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC29.7■■■□□ 2.35
PCNTO95613 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.34
PCNTO95613 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
PCNTO95613 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
PCNTO95613 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
PCNTO95613 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC29.68■■■□□ 2.34
PCNTO95613 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
PCNTO95613 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
PCNTO95613 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
PCNTO95613 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
PCNTO95613 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
PCNTO95613 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
PCNTO95613 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
PCNTO95613 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
PCNTO95613 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
PCNTO95613 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
PCNTO95613 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
PCNTO95613 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
PCNTO95613 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
PCNTO95613 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
PCNTO95613 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
PCNTO95613 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
PCNTO95613 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
PCNTO95613 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
PCNTO95613 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
PCNTO95613 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
PCNTO95613 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
PCNTO95613 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
PCNTO95613 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
PCNTO95613 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
PCNTO95613 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC29.62■■■□□ 2.33
PCNTO95613 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
PCNTO95613 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
PCNTO95613 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC29.62■■■□□ 2.33
PCNTO95613 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
PCNTO95613 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
PCNTO95613 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
PCNTO95613 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC29.6■■■□□ 2.33
PCNTO95613 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
PCNTO95613 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
PCNTO95613 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
PCNTO95613 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
PCNTO95613 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
PCNTO95613 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC29.58■■■□□ 2.33
PCNTO95613 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
PCNTO95613 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
PCNTO95613 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
PCNTO95613 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
PCNTO95613 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
PCNTO95613 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
PCNTO95613 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
PCNTO95613 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
PCNTO95613 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
PCNTO95613 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
PCNTO95613 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms