Protein–RNA interactions for Protein: O43497

CACNA1G, Voltage-dependent T-type calcium channel subunit alpha-1G, humanhuman

Predictions only

Length 2,377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1GO43497 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CACNA1GO43497 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CACNA1GO43497 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CACNA1GO43497 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CACNA1GO43497 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CACNA1GO43497 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CACNA1GO43497 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CACNA1GO43497 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CACNA1GO43497 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CACNA1GO43497 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CACNA1GO43497 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CACNA1GO43497 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
CACNA1GO43497 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CACNA1GO43497 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CACNA1GO43497 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
CACNA1GO43497 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CACNA1GO43497 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CACNA1GO43497 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
CACNA1GO43497 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CACNA1GO43497 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CACNA1GO43497 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CACNA1GO43497 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CACNA1GO43497 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CACNA1GO43497 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CACNA1GO43497 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CACNA1GO43497 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CACNA1GO43497 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CACNA1GO43497 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CACNA1GO43497 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CACNA1GO43497 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CACNA1GO43497 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CACNA1GO43497 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
CACNA1GO43497 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CACNA1GO43497 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CACNA1GO43497 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CACNA1GO43497 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CACNA1GO43497 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CACNA1GO43497 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CACNA1GO43497 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CACNA1GO43497 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CACNA1GO43497 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CACNA1GO43497 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CACNA1GO43497 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CACNA1GO43497 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CACNA1GO43497 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CACNA1GO43497 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CACNA1GO43497 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CACNA1GO43497 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CACNA1GO43497 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CACNA1GO43497 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CACNA1GO43497 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CACNA1GO43497 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CACNA1GO43497 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CACNA1GO43497 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CACNA1GO43497 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CACNA1GO43497 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CACNA1GO43497 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CACNA1GO43497 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.45■■□□□ 1.35
CACNA1GO43497 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CACNA1GO43497 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CACNA1GO43497 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CACNA1GO43497 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CACNA1GO43497 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CACNA1GO43497 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CACNA1GO43497 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CACNA1GO43497 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CACNA1GO43497 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CACNA1GO43497 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CACNA1GO43497 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CACNA1GO43497 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CACNA1GO43497 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CACNA1GO43497 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CACNA1GO43497 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CACNA1GO43497 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CACNA1GO43497 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CACNA1GO43497 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CACNA1GO43497 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CACNA1GO43497 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CACNA1GO43497 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CACNA1GO43497 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CACNA1GO43497 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CACNA1GO43497 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CACNA1GO43497 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CACNA1GO43497 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CACNA1GO43497 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CACNA1GO43497 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CACNA1GO43497 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CACNA1GO43497 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CACNA1GO43497 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CACNA1GO43497 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CACNA1GO43497 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CACNA1GO43497 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CACNA1GO43497 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CACNA1GO43497 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CACNA1GO43497 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CACNA1GO43497 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CACNA1GO43497 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CACNA1GO43497 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CACNA1GO43497 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CACNA1GO43497 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.4 ms