Protein–RNA interactions for Protein: O43325

LYRM1, LYR motif-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LYRM1O43325 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LYRM1O43325 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LYRM1O43325 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LYRM1O43325 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LYRM1O43325 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
LYRM1O43325 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LYRM1O43325 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LYRM1O43325 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LYRM1O43325 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LYRM1O43325 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LYRM1O43325 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LYRM1O43325 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LYRM1O43325 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LYRM1O43325 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LYRM1O43325 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LYRM1O43325 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LYRM1O43325 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LYRM1O43325 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LYRM1O43325 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LYRM1O43325 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LYRM1O43325 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
LYRM1O43325 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
LYRM1O43325 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
LYRM1O43325 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LYRM1O43325 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LYRM1O43325 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LYRM1O43325 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LYRM1O43325 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LYRM1O43325 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LYRM1O43325 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LYRM1O43325 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LYRM1O43325 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
LYRM1O43325 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LYRM1O43325 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LYRM1O43325 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LYRM1O43325 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LYRM1O43325 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LYRM1O43325 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LYRM1O43325 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LYRM1O43325 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LYRM1O43325 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LYRM1O43325 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LYRM1O43325 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LYRM1O43325 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LYRM1O43325 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LYRM1O43325 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LYRM1O43325 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LYRM1O43325 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LYRM1O43325 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LYRM1O43325 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LYRM1O43325 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LYRM1O43325 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LYRM1O43325 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LYRM1O43325 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
LYRM1O43325 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LYRM1O43325 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LYRM1O43325 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LYRM1O43325 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LYRM1O43325 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LYRM1O43325 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
LYRM1O43325 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LYRM1O43325 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
LYRM1O43325 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
LYRM1O43325 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
LYRM1O43325 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LYRM1O43325 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LYRM1O43325 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC21.32■■□□□ 1
LYRM1O43325 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC21.32■■□□□ 1
LYRM1O43325 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LYRM1O43325 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LYRM1O43325 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
LYRM1O43325 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LYRM1O43325 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LYRM1O43325 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
LYRM1O43325 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LYRM1O43325 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LYRM1O43325 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LYRM1O43325 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LYRM1O43325 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LYRM1O43325 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LYRM1O43325 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
LYRM1O43325 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
LYRM1O43325 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LYRM1O43325 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LYRM1O43325 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC21.29■■□□□ 1
LYRM1O43325 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LYRM1O43325 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LYRM1O43325 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
LYRM1O43325 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
LYRM1O43325 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LYRM1O43325 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
LYRM1O43325 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LYRM1O43325 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
LYRM1O43325 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LYRM1O43325 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LYRM1O43325 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LYRM1O43325 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
LYRM1O43325 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
LYRM1O43325 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LYRM1O43325 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms