Protein–RNA interactions for Protein: O14827

RASGRF2, Ras-specific guanine nucleotide-releasing factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASGRF2O14827 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RASGRF2O14827 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RASGRF2O14827 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RASGRF2O14827 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RASGRF2O14827 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RASGRF2O14827 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RASGRF2O14827 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RASGRF2O14827 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
RASGRF2O14827 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RASGRF2O14827 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
RASGRF2O14827 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RASGRF2O14827 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
RASGRF2O14827 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
RASGRF2O14827 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RASGRF2O14827 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RASGRF2O14827 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RASGRF2O14827 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RASGRF2O14827 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
RASGRF2O14827 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RASGRF2O14827 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RASGRF2O14827 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RASGRF2O14827 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RASGRF2O14827 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RASGRF2O14827 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RASGRF2O14827 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RASGRF2O14827 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RASGRF2O14827 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RASGRF2O14827 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RASGRF2O14827 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RASGRF2O14827 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RASGRF2O14827 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RASGRF2O14827 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RASGRF2O14827 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RASGRF2O14827 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RASGRF2O14827 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RASGRF2O14827 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RASGRF2O14827 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RASGRF2O14827 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
RASGRF2O14827 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
RASGRF2O14827 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
RASGRF2O14827 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RASGRF2O14827 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
RASGRF2O14827 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RASGRF2O14827 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RASGRF2O14827 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RASGRF2O14827 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RASGRF2O14827 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RASGRF2O14827 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RASGRF2O14827 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RASGRF2O14827 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RASGRF2O14827 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RASGRF2O14827 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RASGRF2O14827 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RASGRF2O14827 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RASGRF2O14827 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RASGRF2O14827 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RASGRF2O14827 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RASGRF2O14827 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RASGRF2O14827 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RASGRF2O14827 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RASGRF2O14827 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RASGRF2O14827 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RASGRF2O14827 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RASGRF2O14827 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RASGRF2O14827 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RASGRF2O14827 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RASGRF2O14827 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
RASGRF2O14827 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RASGRF2O14827 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RASGRF2O14827 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RASGRF2O14827 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RASGRF2O14827 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RASGRF2O14827 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RASGRF2O14827 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
RASGRF2O14827 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RASGRF2O14827 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RASGRF2O14827 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
RASGRF2O14827 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RASGRF2O14827 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RASGRF2O14827 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RASGRF2O14827 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RASGRF2O14827 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RASGRF2O14827 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RASGRF2O14827 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
RASGRF2O14827 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RASGRF2O14827 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RASGRF2O14827 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RASGRF2O14827 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RASGRF2O14827 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RASGRF2O14827 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RASGRF2O14827 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RASGRF2O14827 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RASGRF2O14827 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RASGRF2O14827 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RASGRF2O14827 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RASGRF2O14827 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RASGRF2O14827 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RASGRF2O14827 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RASGRF2O14827 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RASGRF2O14827 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.8 ms