Protein–RNA interactions for Protein: A6NM43

CCT8L1P, Putative T-complex protein 1 subunit theta-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCT8L1PA6NM43 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCT8L1PA6NM43 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCT8L1PA6NM43 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCT8L1PA6NM43 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCT8L1PA6NM43 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCT8L1PA6NM43 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
CCT8L1PA6NM43 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
CCT8L1PA6NM43 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CCT8L1PA6NM43 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CCT8L1PA6NM43 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CCT8L1PA6NM43 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CCT8L1PA6NM43 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CCT8L1PA6NM43 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCT8L1PA6NM43 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCT8L1PA6NM43 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCT8L1PA6NM43 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCT8L1PA6NM43 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCT8L1PA6NM43 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
CCT8L1PA6NM43 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCT8L1PA6NM43 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCT8L1PA6NM43 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCT8L1PA6NM43 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
CCT8L1PA6NM43 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCT8L1PA6NM43 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCT8L1PA6NM43 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCT8L1PA6NM43 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCT8L1PA6NM43 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCT8L1PA6NM43 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCT8L1PA6NM43 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCT8L1PA6NM43 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCT8L1PA6NM43 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCT8L1PA6NM43 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCT8L1PA6NM43 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCT8L1PA6NM43 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
CCT8L1PA6NM43 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCT8L1PA6NM43 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCT8L1PA6NM43 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCT8L1PA6NM43 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCT8L1PA6NM43 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCT8L1PA6NM43 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCT8L1PA6NM43 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCT8L1PA6NM43 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCT8L1PA6NM43 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCT8L1PA6NM43 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCT8L1PA6NM43 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCT8L1PA6NM43 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCT8L1PA6NM43 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCT8L1PA6NM43 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCT8L1PA6NM43 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCT8L1PA6NM43 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCT8L1PA6NM43 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCT8L1PA6NM43 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCT8L1PA6NM43 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCT8L1PA6NM43 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCT8L1PA6NM43 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCT8L1PA6NM43 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCT8L1PA6NM43 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCT8L1PA6NM43 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCT8L1PA6NM43 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCT8L1PA6NM43 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCT8L1PA6NM43 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCT8L1PA6NM43 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCT8L1PA6NM43 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCT8L1PA6NM43 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCT8L1PA6NM43 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCT8L1PA6NM43 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCT8L1PA6NM43 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCT8L1PA6NM43 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCT8L1PA6NM43 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCT8L1PA6NM43 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
CCT8L1PA6NM43 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
CCT8L1PA6NM43 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCT8L1PA6NM43 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCT8L1PA6NM43 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCT8L1PA6NM43 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCT8L1PA6NM43 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCT8L1PA6NM43 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCT8L1PA6NM43 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCT8L1PA6NM43 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCT8L1PA6NM43 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCT8L1PA6NM43 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCT8L1PA6NM43 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCT8L1PA6NM43 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCT8L1PA6NM43 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCT8L1PA6NM43 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCT8L1PA6NM43 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCT8L1PA6NM43 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCT8L1PA6NM43 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCT8L1PA6NM43 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCT8L1PA6NM43 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
CCT8L1PA6NM43 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CCT8L1PA6NM43 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CCT8L1PA6NM43 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCT8L1PA6NM43 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCT8L1PA6NM43 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCT8L1PA6NM43 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCT8L1PA6NM43 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCT8L1PA6NM43 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCT8L1PA6NM43 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCT8L1PA6NM43 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms