Protein–RNA interactions for Protein: Q8TE82

SH3TC1, SH3 domain and tetratricopeptide repeat-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3TC1Q8TE82 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SH3TC1Q8TE82 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SH3TC1Q8TE82 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SH3TC1Q8TE82 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
SH3TC1Q8TE82 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SH3TC1Q8TE82 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SH3TC1Q8TE82 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
SH3TC1Q8TE82 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SH3TC1Q8TE82 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SH3TC1Q8TE82 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SH3TC1Q8TE82 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SH3TC1Q8TE82 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SH3TC1Q8TE82 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SH3TC1Q8TE82 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SH3TC1Q8TE82 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SH3TC1Q8TE82 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SH3TC1Q8TE82 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SH3TC1Q8TE82 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SH3TC1Q8TE82 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SH3TC1Q8TE82 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SH3TC1Q8TE82 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SH3TC1Q8TE82 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SH3TC1Q8TE82 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SH3TC1Q8TE82 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SH3TC1Q8TE82 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
SH3TC1Q8TE82 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SH3TC1Q8TE82 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SH3TC1Q8TE82 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SH3TC1Q8TE82 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SH3TC1Q8TE82 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SH3TC1Q8TE82 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SH3TC1Q8TE82 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SH3TC1Q8TE82 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SH3TC1Q8TE82 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SH3TC1Q8TE82 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SH3TC1Q8TE82 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SH3TC1Q8TE82 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SH3TC1Q8TE82 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SH3TC1Q8TE82 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SH3TC1Q8TE82 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SH3TC1Q8TE82 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SH3TC1Q8TE82 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
SH3TC1Q8TE82 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SH3TC1Q8TE82 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SH3TC1Q8TE82 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SH3TC1Q8TE82 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SH3TC1Q8TE82 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SH3TC1Q8TE82 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SH3TC1Q8TE82 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SH3TC1Q8TE82 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SH3TC1Q8TE82 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SH3TC1Q8TE82 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SH3TC1Q8TE82 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SH3TC1Q8TE82 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SH3TC1Q8TE82 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SH3TC1Q8TE82 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SH3TC1Q8TE82 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SH3TC1Q8TE82 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
SH3TC1Q8TE82 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
SH3TC1Q8TE82 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
SH3TC1Q8TE82 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SH3TC1Q8TE82 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SH3TC1Q8TE82 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SH3TC1Q8TE82 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SH3TC1Q8TE82 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SH3TC1Q8TE82 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SH3TC1Q8TE82 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SH3TC1Q8TE82 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SH3TC1Q8TE82 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SH3TC1Q8TE82 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SH3TC1Q8TE82 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SH3TC1Q8TE82 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SH3TC1Q8TE82 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
SH3TC1Q8TE82 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SH3TC1Q8TE82 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
SH3TC1Q8TE82 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SH3TC1Q8TE82 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SH3TC1Q8TE82 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
SH3TC1Q8TE82 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SH3TC1Q8TE82 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
SH3TC1Q8TE82 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SH3TC1Q8TE82 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SH3TC1Q8TE82 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SH3TC1Q8TE82 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SH3TC1Q8TE82 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SH3TC1Q8TE82 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SH3TC1Q8TE82 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SH3TC1Q8TE82 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SH3TC1Q8TE82 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SH3TC1Q8TE82 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SH3TC1Q8TE82 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SH3TC1Q8TE82 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SH3TC1Q8TE82 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SH3TC1Q8TE82 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SH3TC1Q8TE82 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SH3TC1Q8TE82 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SH3TC1Q8TE82 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SH3TC1Q8TE82 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SH3TC1Q8TE82 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SH3TC1Q8TE82 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.8 ms