Protein–RNA interactions for Protein: P53992

SEC24C, Protein transport protein Sec24C, humanhuman

Predictions only

Length 1,094 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC24CP53992 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SEC24CP53992 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SEC24CP53992 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SEC24CP53992 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
SEC24CP53992 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SEC24CP53992 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SEC24CP53992 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SEC24CP53992 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
SEC24CP53992 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SEC24CP53992 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SEC24CP53992 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SEC24CP53992 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SEC24CP53992 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SEC24CP53992 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
SEC24CP53992 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SEC24CP53992 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SEC24CP53992 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SEC24CP53992 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SEC24CP53992 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SEC24CP53992 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SEC24CP53992 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SEC24CP53992 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SEC24CP53992 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SEC24CP53992 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SEC24CP53992 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SEC24CP53992 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SEC24CP53992 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SEC24CP53992 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SEC24CP53992 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SEC24CP53992 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SEC24CP53992 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SEC24CP53992 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SEC24CP53992 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SEC24CP53992 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SEC24CP53992 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SEC24CP53992 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SEC24CP53992 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SEC24CP53992 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
SEC24CP53992 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SEC24CP53992 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SEC24CP53992 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SEC24CP53992 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SEC24CP53992 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SEC24CP53992 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SEC24CP53992 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SEC24CP53992 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SEC24CP53992 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SEC24CP53992 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SEC24CP53992 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SEC24CP53992 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SEC24CP53992 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SEC24CP53992 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SEC24CP53992 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SEC24CP53992 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SEC24CP53992 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SEC24CP53992 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SEC24CP53992 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SEC24CP53992 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SEC24CP53992 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SEC24CP53992 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SEC24CP53992 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SEC24CP53992 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SEC24CP53992 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SEC24CP53992 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SEC24CP53992 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SEC24CP53992 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SEC24CP53992 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SEC24CP53992 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SEC24CP53992 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SEC24CP53992 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SEC24CP53992 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SEC24CP53992 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SEC24CP53992 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SEC24CP53992 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SEC24CP53992 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SEC24CP53992 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SEC24CP53992 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SEC24CP53992 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SEC24CP53992 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SEC24CP53992 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SEC24CP53992 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SEC24CP53992 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SEC24CP53992 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SEC24CP53992 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SEC24CP53992 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SEC24CP53992 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SEC24CP53992 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SEC24CP53992 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SEC24CP53992 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SEC24CP53992 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SEC24CP53992 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SEC24CP53992 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SEC24CP53992 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SEC24CP53992 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SEC24CP53992 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SEC24CP53992 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SEC24CP53992 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SEC24CP53992 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SEC24CP53992 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SEC24CP53992 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms