Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKI3

VPREB3, Pre-B lymphocyte protein 3, humanhuman

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Length 123 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB3Q9UKI3 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
VPREB3Q9UKI3 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
VPREB3Q9UKI3 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
VPREB3Q9UKI3 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
VPREB3Q9UKI3 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
VPREB3Q9UKI3 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
VPREB3Q9UKI3 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
VPREB3Q9UKI3 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
VPREB3Q9UKI3 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
VPREB3Q9UKI3 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
VPREB3Q9UKI3 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
VPREB3Q9UKI3 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
VPREB3Q9UKI3 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
VPREB3Q9UKI3 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
VPREB3Q9UKI3 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
VPREB3Q9UKI3 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
VPREB3Q9UKI3 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
VPREB3Q9UKI3 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
VPREB3Q9UKI3 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
VPREB3Q9UKI3 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
VPREB3Q9UKI3 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
VPREB3Q9UKI3 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
VPREB3Q9UKI3 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
VPREB3Q9UKI3 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
VPREB3Q9UKI3 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
VPREB3Q9UKI3 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
VPREB3Q9UKI3 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
VPREB3Q9UKI3 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
VPREB3Q9UKI3 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
VPREB3Q9UKI3 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
VPREB3Q9UKI3 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
VPREB3Q9UKI3 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
VPREB3Q9UKI3 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
VPREB3Q9UKI3 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
VPREB3Q9UKI3 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
VPREB3Q9UKI3 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
VPREB3Q9UKI3 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
VPREB3Q9UKI3 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
VPREB3Q9UKI3 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
VPREB3Q9UKI3 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
VPREB3Q9UKI3 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
VPREB3Q9UKI3 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
VPREB3Q9UKI3 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
VPREB3Q9UKI3 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
VPREB3Q9UKI3 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
VPREB3Q9UKI3 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
VPREB3Q9UKI3 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
VPREB3Q9UKI3 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
VPREB3Q9UKI3 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
VPREB3Q9UKI3 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
VPREB3Q9UKI3 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
VPREB3Q9UKI3 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
VPREB3Q9UKI3 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
VPREB3Q9UKI3 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
VPREB3Q9UKI3 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
VPREB3Q9UKI3 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
VPREB3Q9UKI3 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
VPREB3Q9UKI3 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
VPREB3Q9UKI3 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
VPREB3Q9UKI3 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
VPREB3Q9UKI3 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
VPREB3Q9UKI3 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
VPREB3Q9UKI3 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
VPREB3Q9UKI3 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
VPREB3Q9UKI3 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
VPREB3Q9UKI3 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
VPREB3Q9UKI3 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
VPREB3Q9UKI3 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
VPREB3Q9UKI3 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
VPREB3Q9UKI3 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
VPREB3Q9UKI3 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
VPREB3Q9UKI3 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
VPREB3Q9UKI3 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
VPREB3Q9UKI3 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
VPREB3Q9UKI3 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
VPREB3Q9UKI3 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
VPREB3Q9UKI3 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
VPREB3Q9UKI3 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
VPREB3Q9UKI3 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
VPREB3Q9UKI3 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
VPREB3Q9UKI3 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
VPREB3Q9UKI3 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
VPREB3Q9UKI3 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
VPREB3Q9UKI3 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
VPREB3Q9UKI3 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
VPREB3Q9UKI3 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
VPREB3Q9UKI3 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
VPREB3Q9UKI3 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
VPREB3Q9UKI3 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
VPREB3Q9UKI3 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
VPREB3Q9UKI3 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
VPREB3Q9UKI3 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
VPREB3Q9UKI3 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
VPREB3Q9UKI3 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
VPREB3Q9UKI3 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
VPREB3Q9UKI3 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
VPREB3Q9UKI3 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
VPREB3Q9UKI3 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
VPREB3Q9UKI3 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
VPREB3Q9UKI3 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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