Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCJ5

SPRYD3, SPRY domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPRYD3Q8NCJ5 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SPRYD3Q8NCJ5 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SPRYD3Q8NCJ5 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SPRYD3Q8NCJ5 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SPRYD3Q8NCJ5 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SPRYD3Q8NCJ5 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SPRYD3Q8NCJ5 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SPRYD3Q8NCJ5 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SPRYD3Q8NCJ5 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SPRYD3Q8NCJ5 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SPRYD3Q8NCJ5 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SPRYD3Q8NCJ5 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SPRYD3Q8NCJ5 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SPRYD3Q8NCJ5 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SPRYD3Q8NCJ5 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SPRYD3Q8NCJ5 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SPRYD3Q8NCJ5 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SPRYD3Q8NCJ5 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SPRYD3Q8NCJ5 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SPRYD3Q8NCJ5 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SPRYD3Q8NCJ5 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SPRYD3Q8NCJ5 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SPRYD3Q8NCJ5 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SPRYD3Q8NCJ5 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SPRYD3Q8NCJ5 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SPRYD3Q8NCJ5 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SPRYD3Q8NCJ5 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SPRYD3Q8NCJ5 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SPRYD3Q8NCJ5 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SPRYD3Q8NCJ5 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SPRYD3Q8NCJ5 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SPRYD3Q8NCJ5 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SPRYD3Q8NCJ5 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SPRYD3Q8NCJ5 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SPRYD3Q8NCJ5 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SPRYD3Q8NCJ5 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SPRYD3Q8NCJ5 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPRYD3Q8NCJ5 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPRYD3Q8NCJ5 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPRYD3Q8NCJ5 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPRYD3Q8NCJ5 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPRYD3Q8NCJ5 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPRYD3Q8NCJ5 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPRYD3Q8NCJ5 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPRYD3Q8NCJ5 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPRYD3Q8NCJ5 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPRYD3Q8NCJ5 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPRYD3Q8NCJ5 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPRYD3Q8NCJ5 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SPRYD3Q8NCJ5 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPRYD3Q8NCJ5 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPRYD3Q8NCJ5 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPRYD3Q8NCJ5 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SPRYD3Q8NCJ5 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPRYD3Q8NCJ5 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPRYD3Q8NCJ5 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SPRYD3Q8NCJ5 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPRYD3Q8NCJ5 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPRYD3Q8NCJ5 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPRYD3Q8NCJ5 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPRYD3Q8NCJ5 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPRYD3Q8NCJ5 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPRYD3Q8NCJ5 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPRYD3Q8NCJ5 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPRYD3Q8NCJ5 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPRYD3Q8NCJ5 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPRYD3Q8NCJ5 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPRYD3Q8NCJ5 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPRYD3Q8NCJ5 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPRYD3Q8NCJ5 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPRYD3Q8NCJ5 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SPRYD3Q8NCJ5 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPRYD3Q8NCJ5 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPRYD3Q8NCJ5 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPRYD3Q8NCJ5 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPRYD3Q8NCJ5 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPRYD3Q8NCJ5 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPRYD3Q8NCJ5 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPRYD3Q8NCJ5 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPRYD3Q8NCJ5 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPRYD3Q8NCJ5 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPRYD3Q8NCJ5 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPRYD3Q8NCJ5 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPRYD3Q8NCJ5 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPRYD3Q8NCJ5 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPRYD3Q8NCJ5 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPRYD3Q8NCJ5 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPRYD3Q8NCJ5 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPRYD3Q8NCJ5 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPRYD3Q8NCJ5 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPRYD3Q8NCJ5 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPRYD3Q8NCJ5 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPRYD3Q8NCJ5 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPRYD3Q8NCJ5 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPRYD3Q8NCJ5 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPRYD3Q8NCJ5 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPRYD3Q8NCJ5 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPRYD3Q8NCJ5 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPRYD3Q8NCJ5 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SPRYD3Q8NCJ5 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.3 ms