Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCJ5

SPRYD3, SPRY domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPRYD3Q8NCJ5 LINC00511-205ENST00000578206 908 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SPRYD3Q8NCJ5 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SPRYD3Q8NCJ5 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SPRYD3Q8NCJ5 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SPRYD3Q8NCJ5 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SPRYD3Q8NCJ5 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SPRYD3Q8NCJ5 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SPRYD3Q8NCJ5 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SPRYD3Q8NCJ5 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SPRYD3Q8NCJ5 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SPRYD3Q8NCJ5 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SPRYD3Q8NCJ5 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SPRYD3Q8NCJ5 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SPRYD3Q8NCJ5 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SPRYD3Q8NCJ5 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SPRYD3Q8NCJ5 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SPRYD3Q8NCJ5 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SPRYD3Q8NCJ5 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SPRYD3Q8NCJ5 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SPRYD3Q8NCJ5 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SPRYD3Q8NCJ5 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SPRYD3Q8NCJ5 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SPRYD3Q8NCJ5 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SPRYD3Q8NCJ5 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SPRYD3Q8NCJ5 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SPRYD3Q8NCJ5 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SPRYD3Q8NCJ5 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SPRYD3Q8NCJ5 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SPRYD3Q8NCJ5 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SPRYD3Q8NCJ5 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SPRYD3Q8NCJ5 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SPRYD3Q8NCJ5 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SPRYD3Q8NCJ5 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SPRYD3Q8NCJ5 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SPRYD3Q8NCJ5 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SPRYD3Q8NCJ5 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SPRYD3Q8NCJ5 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SPRYD3Q8NCJ5 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SPRYD3Q8NCJ5 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SPRYD3Q8NCJ5 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SPRYD3Q8NCJ5 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SPRYD3Q8NCJ5 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SPRYD3Q8NCJ5 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SPRYD3Q8NCJ5 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SPRYD3Q8NCJ5 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SPRYD3Q8NCJ5 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SPRYD3Q8NCJ5 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SPRYD3Q8NCJ5 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SPRYD3Q8NCJ5 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SPRYD3Q8NCJ5 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SPRYD3Q8NCJ5 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SPRYD3Q8NCJ5 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SPRYD3Q8NCJ5 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SPRYD3Q8NCJ5 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SPRYD3Q8NCJ5 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SPRYD3Q8NCJ5 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SPRYD3Q8NCJ5 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SPRYD3Q8NCJ5 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SPRYD3Q8NCJ5 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SPRYD3Q8NCJ5 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SPRYD3Q8NCJ5 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SPRYD3Q8NCJ5 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SPRYD3Q8NCJ5 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SPRYD3Q8NCJ5 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SPRYD3Q8NCJ5 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SPRYD3Q8NCJ5 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SPRYD3Q8NCJ5 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SPRYD3Q8NCJ5 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SPRYD3Q8NCJ5 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SPRYD3Q8NCJ5 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SPRYD3Q8NCJ5 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SPRYD3Q8NCJ5 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SPRYD3Q8NCJ5 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SPRYD3Q8NCJ5 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SPRYD3Q8NCJ5 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SPRYD3Q8NCJ5 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SPRYD3Q8NCJ5 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SPRYD3Q8NCJ5 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SPRYD3Q8NCJ5 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SPRYD3Q8NCJ5 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SPRYD3Q8NCJ5 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SPRYD3Q8NCJ5 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SPRYD3Q8NCJ5 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SPRYD3Q8NCJ5 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SPRYD3Q8NCJ5 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SPRYD3Q8NCJ5 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SPRYD3Q8NCJ5 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SPRYD3Q8NCJ5 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SPRYD3Q8NCJ5 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SPRYD3Q8NCJ5 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SPRYD3Q8NCJ5 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SPRYD3Q8NCJ5 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SPRYD3Q8NCJ5 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SPRYD3Q8NCJ5 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SPRYD3Q8NCJ5 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SPRYD3Q8NCJ5 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SPRYD3Q8NCJ5 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SPRYD3Q8NCJ5 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SPRYD3Q8NCJ5 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SPRYD3Q8NCJ5 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.5 ms