Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCJ5

SPRYD3, SPRY domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPRYD3Q8NCJ5 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SPRYD3Q8NCJ5 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SPRYD3Q8NCJ5 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SPRYD3Q8NCJ5 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SPRYD3Q8NCJ5 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SPRYD3Q8NCJ5 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SPRYD3Q8NCJ5 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SPRYD3Q8NCJ5 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SPRYD3Q8NCJ5 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SPRYD3Q8NCJ5 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SPRYD3Q8NCJ5 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SPRYD3Q8NCJ5 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SPRYD3Q8NCJ5 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SPRYD3Q8NCJ5 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SPRYD3Q8NCJ5 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SPRYD3Q8NCJ5 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SPRYD3Q8NCJ5 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SPRYD3Q8NCJ5 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SPRYD3Q8NCJ5 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SPRYD3Q8NCJ5 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SPRYD3Q8NCJ5 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SPRYD3Q8NCJ5 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SPRYD3Q8NCJ5 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SPRYD3Q8NCJ5 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SPRYD3Q8NCJ5 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SPRYD3Q8NCJ5 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SPRYD3Q8NCJ5 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SPRYD3Q8NCJ5 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SPRYD3Q8NCJ5 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SPRYD3Q8NCJ5 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SPRYD3Q8NCJ5 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SPRYD3Q8NCJ5 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SPRYD3Q8NCJ5 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SPRYD3Q8NCJ5 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SPRYD3Q8NCJ5 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SPRYD3Q8NCJ5 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SPRYD3Q8NCJ5 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SPRYD3Q8NCJ5 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SPRYD3Q8NCJ5 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SPRYD3Q8NCJ5 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SPRYD3Q8NCJ5 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SPRYD3Q8NCJ5 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SPRYD3Q8NCJ5 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SPRYD3Q8NCJ5 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SPRYD3Q8NCJ5 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SPRYD3Q8NCJ5 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SPRYD3Q8NCJ5 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SPRYD3Q8NCJ5 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SPRYD3Q8NCJ5 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SPRYD3Q8NCJ5 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SPRYD3Q8NCJ5 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SPRYD3Q8NCJ5 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SPRYD3Q8NCJ5 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SPRYD3Q8NCJ5 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SPRYD3Q8NCJ5 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SPRYD3Q8NCJ5 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SPRYD3Q8NCJ5 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SPRYD3Q8NCJ5 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SPRYD3Q8NCJ5 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SPRYD3Q8NCJ5 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SPRYD3Q8NCJ5 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SPRYD3Q8NCJ5 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SPRYD3Q8NCJ5 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SPRYD3Q8NCJ5 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SPRYD3Q8NCJ5 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SPRYD3Q8NCJ5 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SPRYD3Q8NCJ5 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SPRYD3Q8NCJ5 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SPRYD3Q8NCJ5 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SPRYD3Q8NCJ5 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SPRYD3Q8NCJ5 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SPRYD3Q8NCJ5 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SPRYD3Q8NCJ5 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SPRYD3Q8NCJ5 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SPRYD3Q8NCJ5 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SPRYD3Q8NCJ5 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SPRYD3Q8NCJ5 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SPRYD3Q8NCJ5 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SPRYD3Q8NCJ5 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SPRYD3Q8NCJ5 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SPRYD3Q8NCJ5 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SPRYD3Q8NCJ5 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SPRYD3Q8NCJ5 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SPRYD3Q8NCJ5 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SPRYD3Q8NCJ5 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SPRYD3Q8NCJ5 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SPRYD3Q8NCJ5 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SPRYD3Q8NCJ5 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SPRYD3Q8NCJ5 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SPRYD3Q8NCJ5 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SPRYD3Q8NCJ5 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SPRYD3Q8NCJ5 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SPRYD3Q8NCJ5 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SPRYD3Q8NCJ5 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SPRYD3Q8NCJ5 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SPRYD3Q8NCJ5 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SPRYD3Q8NCJ5 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SPRYD3Q8NCJ5 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SPRYD3Q8NCJ5 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SPRYD3Q8NCJ5 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.4 ms