Protein–RNA interactions for Protein: Q16394

EXT1, Exostosin-1, humanhuman

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Length 746 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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EXT1Q16394 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
EXT1Q16394 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EXT1Q16394 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
EXT1Q16394 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EXT1Q16394 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
EXT1Q16394 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EXT1Q16394 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
EXT1Q16394 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EXT1Q16394 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
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EXT1Q16394 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
EXT1Q16394 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
EXT1Q16394 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EXT1Q16394 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EXT1Q16394 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EXT1Q16394 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
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EXT1Q16394 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EXT1Q16394 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
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EXT1Q16394 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EXT1Q16394 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EXT1Q16394 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EXT1Q16394 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EXT1Q16394 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EXT1Q16394 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EXT1Q16394 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EXT1Q16394 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EXT1Q16394 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EXT1Q16394 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EXT1Q16394 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EXT1Q16394 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EXT1Q16394 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EXT1Q16394 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EXT1Q16394 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EXT1Q16394 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EXT1Q16394 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EXT1Q16394 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EXT1Q16394 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EXT1Q16394 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EXT1Q16394 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
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EXT1Q16394 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
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EXT1Q16394 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EXT1Q16394 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EXT1Q16394 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EXT1Q16394 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EXT1Q16394 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
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EXT1Q16394 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
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EXT1Q16394 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EXT1Q16394 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
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EXT1Q16394 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EXT1Q16394 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
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EXT1Q16394 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EXT1Q16394 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EXT1Q16394 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EXT1Q16394 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
EXT1Q16394 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
EXT1Q16394 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EXT1Q16394 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
EXT1Q16394 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EXT1Q16394 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
EXT1Q16394 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EXT1Q16394 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
EXT1Q16394 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
EXT1Q16394 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
EXT1Q16394 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EXT1Q16394 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EXT1Q16394 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EXT1Q16394 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
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