Protein–RNA interactions for Protein: P04183

TK1, Thymidine kinase, cytosolic, humanhuman

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TK1P04183 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TK1P04183 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TK1P04183 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TK1P04183 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TK1P04183 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TK1P04183 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TK1P04183 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TK1P04183 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TK1P04183 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TK1P04183 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TK1P04183 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TK1P04183 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TK1P04183 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TK1P04183 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TK1P04183 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
TK1P04183 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
TK1P04183 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TK1P04183 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TK1P04183 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TK1P04183 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TK1P04183 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TK1P04183 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TK1P04183 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TK1P04183 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TK1P04183 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TK1P04183 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TK1P04183 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TK1P04183 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TK1P04183 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TK1P04183 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TK1P04183 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TK1P04183 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TK1P04183 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TK1P04183 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TK1P04183 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
TK1P04183 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TK1P04183 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TK1P04183 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TK1P04183 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TK1P04183 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TK1P04183 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TK1P04183 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TK1P04183 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TK1P04183 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TK1P04183 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
TK1P04183 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TK1P04183 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TK1P04183 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TK1P04183 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TK1P04183 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TK1P04183 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TK1P04183 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TK1P04183 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TK1P04183 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TK1P04183 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TK1P04183 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TK1P04183 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TK1P04183 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TK1P04183 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TK1P04183 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TK1P04183 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TK1P04183 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TK1P04183 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TK1P04183 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TK1P04183 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TK1P04183 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TK1P04183 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TK1P04183 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TK1P04183 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TK1P04183 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TK1P04183 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TK1P04183 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TK1P04183 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TK1P04183 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TK1P04183 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TK1P04183 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
TK1P04183 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TK1P04183 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TK1P04183 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TK1P04183 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TK1P04183 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
TK1P04183 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TK1P04183 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TK1P04183 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TK1P04183 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TK1P04183 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TK1P04183 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TK1P04183 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TK1P04183 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TK1P04183 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TK1P04183 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TK1P04183 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TK1P04183 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TK1P04183 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TK1P04183 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
TK1P04183 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TK1P04183 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TK1P04183 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
TK1P04183 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TK1P04183 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms