Protein–RNA interactions for Protein: U3KPV4

A3GALT2, Alpha-1,3-galactosyltransferase 2, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A3GALT2U3KPV4 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
A3GALT2U3KPV4 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
A3GALT2U3KPV4 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
A3GALT2U3KPV4 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
A3GALT2U3KPV4 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
A3GALT2U3KPV4 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
A3GALT2U3KPV4 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
A3GALT2U3KPV4 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
A3GALT2U3KPV4 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
A3GALT2U3KPV4 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
A3GALT2U3KPV4 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
A3GALT2U3KPV4 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
A3GALT2U3KPV4 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
A3GALT2U3KPV4 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
A3GALT2U3KPV4 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
A3GALT2U3KPV4 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
A3GALT2U3KPV4 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
A3GALT2U3KPV4 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
A3GALT2U3KPV4 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
A3GALT2U3KPV4 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
A3GALT2U3KPV4 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
A3GALT2U3KPV4 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
A3GALT2U3KPV4 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
A3GALT2U3KPV4 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
A3GALT2U3KPV4 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
A3GALT2U3KPV4 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
A3GALT2U3KPV4 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
A3GALT2U3KPV4 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
A3GALT2U3KPV4 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
A3GALT2U3KPV4 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
A3GALT2U3KPV4 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
A3GALT2U3KPV4 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
A3GALT2U3KPV4 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
A3GALT2U3KPV4 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
A3GALT2U3KPV4 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
A3GALT2U3KPV4 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
A3GALT2U3KPV4 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
A3GALT2U3KPV4 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
A3GALT2U3KPV4 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
A3GALT2U3KPV4 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
A3GALT2U3KPV4 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
A3GALT2U3KPV4 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
A3GALT2U3KPV4 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
A3GALT2U3KPV4 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
A3GALT2U3KPV4 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
A3GALT2U3KPV4 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
A3GALT2U3KPV4 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
A3GALT2U3KPV4 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
A3GALT2U3KPV4 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
A3GALT2U3KPV4 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
A3GALT2U3KPV4 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
A3GALT2U3KPV4 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
A3GALT2U3KPV4 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
A3GALT2U3KPV4 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
A3GALT2U3KPV4 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
A3GALT2U3KPV4 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
A3GALT2U3KPV4 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
A3GALT2U3KPV4 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
A3GALT2U3KPV4 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
A3GALT2U3KPV4 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
A3GALT2U3KPV4 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
A3GALT2U3KPV4 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
A3GALT2U3KPV4 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
A3GALT2U3KPV4 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
A3GALT2U3KPV4 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
A3GALT2U3KPV4 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
A3GALT2U3KPV4 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
A3GALT2U3KPV4 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
A3GALT2U3KPV4 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
A3GALT2U3KPV4 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
A3GALT2U3KPV4 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
A3GALT2U3KPV4 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
A3GALT2U3KPV4 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
A3GALT2U3KPV4 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
A3GALT2U3KPV4 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
A3GALT2U3KPV4 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
A3GALT2U3KPV4 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
A3GALT2U3KPV4 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
A3GALT2U3KPV4 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
A3GALT2U3KPV4 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
A3GALT2U3KPV4 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
A3GALT2U3KPV4 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
A3GALT2U3KPV4 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
A3GALT2U3KPV4 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
A3GALT2U3KPV4 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
A3GALT2U3KPV4 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
A3GALT2U3KPV4 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
A3GALT2U3KPV4 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
A3GALT2U3KPV4 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
A3GALT2U3KPV4 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
A3GALT2U3KPV4 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
A3GALT2U3KPV4 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
A3GALT2U3KPV4 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
A3GALT2U3KPV4 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
A3GALT2U3KPV4 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
A3GALT2U3KPV4 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
A3GALT2U3KPV4 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
A3GALT2U3KPV4 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
A3GALT2U3KPV4 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
A3GALT2U3KPV4 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 113 ms