Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4F1

FARP1, FERM, RhoGEF and pleckstrin domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,045 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FARP1Q9Y4F1 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
FARP1Q9Y4F1 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
FARP1Q9Y4F1 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
FARP1Q9Y4F1 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
FARP1Q9Y4F1 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
FARP1Q9Y4F1 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
FARP1Q9Y4F1 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
FARP1Q9Y4F1 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
FARP1Q9Y4F1 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
FARP1Q9Y4F1 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
FARP1Q9Y4F1 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
FARP1Q9Y4F1 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
FARP1Q9Y4F1 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
FARP1Q9Y4F1 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
FARP1Q9Y4F1 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
FARP1Q9Y4F1 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
FARP1Q9Y4F1 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
FARP1Q9Y4F1 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
FARP1Q9Y4F1 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
FARP1Q9Y4F1 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
FARP1Q9Y4F1 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
FARP1Q9Y4F1 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
FARP1Q9Y4F1 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
FARP1Q9Y4F1 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
FARP1Q9Y4F1 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
FARP1Q9Y4F1 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
FARP1Q9Y4F1 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
FARP1Q9Y4F1 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
FARP1Q9Y4F1 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
FARP1Q9Y4F1 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
FARP1Q9Y4F1 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
FARP1Q9Y4F1 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
FARP1Q9Y4F1 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
FARP1Q9Y4F1 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
FARP1Q9Y4F1 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
FARP1Q9Y4F1 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
FARP1Q9Y4F1 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
FARP1Q9Y4F1 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
FARP1Q9Y4F1 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
FARP1Q9Y4F1 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
FARP1Q9Y4F1 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
FARP1Q9Y4F1 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
FARP1Q9Y4F1 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
FARP1Q9Y4F1 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
FARP1Q9Y4F1 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
FARP1Q9Y4F1 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
FARP1Q9Y4F1 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
FARP1Q9Y4F1 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
FARP1Q9Y4F1 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
FARP1Q9Y4F1 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
FARP1Q9Y4F1 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
FARP1Q9Y4F1 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
FARP1Q9Y4F1 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
FARP1Q9Y4F1 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
FARP1Q9Y4F1 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
FARP1Q9Y4F1 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
FARP1Q9Y4F1 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
FARP1Q9Y4F1 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
FARP1Q9Y4F1 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
FARP1Q9Y4F1 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
FARP1Q9Y4F1 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
FARP1Q9Y4F1 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
FARP1Q9Y4F1 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
FARP1Q9Y4F1 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
FARP1Q9Y4F1 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
FARP1Q9Y4F1 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
FARP1Q9Y4F1 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
FARP1Q9Y4F1 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
FARP1Q9Y4F1 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
FARP1Q9Y4F1 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
FARP1Q9Y4F1 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
FARP1Q9Y4F1 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
FARP1Q9Y4F1 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
FARP1Q9Y4F1 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
FARP1Q9Y4F1 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
FARP1Q9Y4F1 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
FARP1Q9Y4F1 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
FARP1Q9Y4F1 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
FARP1Q9Y4F1 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
FARP1Q9Y4F1 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
FARP1Q9Y4F1 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
FARP1Q9Y4F1 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
FARP1Q9Y4F1 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
FARP1Q9Y4F1 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
FARP1Q9Y4F1 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
FARP1Q9Y4F1 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
FARP1Q9Y4F1 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
FARP1Q9Y4F1 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC26■■□□□ 1.75
FARP1Q9Y4F1 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
FARP1Q9Y4F1 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
FARP1Q9Y4F1 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
FARP1Q9Y4F1 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
FARP1Q9Y4F1 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.99■■□□□ 1.75
FARP1Q9Y4F1 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
FARP1Q9Y4F1 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
FARP1Q9Y4F1 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
FARP1Q9Y4F1 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
FARP1Q9Y4F1 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
FARP1Q9Y4F1 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
FARP1Q9Y4F1 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.4 ms