Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRJ5

PAPOLB, Poly(A) polymerase beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 636 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAPOLBQ9NRJ5 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PAPOLBQ9NRJ5 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PAPOLBQ9NRJ5 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
PAPOLBQ9NRJ5 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PAPOLBQ9NRJ5 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PAPOLBQ9NRJ5 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PAPOLBQ9NRJ5 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PAPOLBQ9NRJ5 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PAPOLBQ9NRJ5 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PAPOLBQ9NRJ5 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PAPOLBQ9NRJ5 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PAPOLBQ9NRJ5 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PAPOLBQ9NRJ5 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
PAPOLBQ9NRJ5 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PAPOLBQ9NRJ5 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PAPOLBQ9NRJ5 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PAPOLBQ9NRJ5 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PAPOLBQ9NRJ5 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PAPOLBQ9NRJ5 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PAPOLBQ9NRJ5 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PAPOLBQ9NRJ5 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PAPOLBQ9NRJ5 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PAPOLBQ9NRJ5 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PAPOLBQ9NRJ5 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PAPOLBQ9NRJ5 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PAPOLBQ9NRJ5 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PAPOLBQ9NRJ5 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PAPOLBQ9NRJ5 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PAPOLBQ9NRJ5 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PAPOLBQ9NRJ5 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PAPOLBQ9NRJ5 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PAPOLBQ9NRJ5 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PAPOLBQ9NRJ5 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PAPOLBQ9NRJ5 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PAPOLBQ9NRJ5 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PAPOLBQ9NRJ5 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PAPOLBQ9NRJ5 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PAPOLBQ9NRJ5 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PAPOLBQ9NRJ5 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PAPOLBQ9NRJ5 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PAPOLBQ9NRJ5 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PAPOLBQ9NRJ5 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PAPOLBQ9NRJ5 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PAPOLBQ9NRJ5 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PAPOLBQ9NRJ5 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
PAPOLBQ9NRJ5 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PAPOLBQ9NRJ5 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PAPOLBQ9NRJ5 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PAPOLBQ9NRJ5 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PAPOLBQ9NRJ5 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PAPOLBQ9NRJ5 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
PAPOLBQ9NRJ5 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PAPOLBQ9NRJ5 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PAPOLBQ9NRJ5 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PAPOLBQ9NRJ5 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PAPOLBQ9NRJ5 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PAPOLBQ9NRJ5 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PAPOLBQ9NRJ5 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PAPOLBQ9NRJ5 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PAPOLBQ9NRJ5 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PAPOLBQ9NRJ5 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PAPOLBQ9NRJ5 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PAPOLBQ9NRJ5 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PAPOLBQ9NRJ5 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
PAPOLBQ9NRJ5 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PAPOLBQ9NRJ5 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PAPOLBQ9NRJ5 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PAPOLBQ9NRJ5 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PAPOLBQ9NRJ5 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PAPOLBQ9NRJ5 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PAPOLBQ9NRJ5 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PAPOLBQ9NRJ5 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PAPOLBQ9NRJ5 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PAPOLBQ9NRJ5 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
PAPOLBQ9NRJ5 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PAPOLBQ9NRJ5 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PAPOLBQ9NRJ5 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PAPOLBQ9NRJ5 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PAPOLBQ9NRJ5 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PAPOLBQ9NRJ5 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PAPOLBQ9NRJ5 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PAPOLBQ9NRJ5 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PAPOLBQ9NRJ5 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PAPOLBQ9NRJ5 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PAPOLBQ9NRJ5 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PAPOLBQ9NRJ5 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PAPOLBQ9NRJ5 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PAPOLBQ9NRJ5 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PAPOLBQ9NRJ5 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PAPOLBQ9NRJ5 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PAPOLBQ9NRJ5 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PAPOLBQ9NRJ5 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PAPOLBQ9NRJ5 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PAPOLBQ9NRJ5 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PAPOLBQ9NRJ5 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PAPOLBQ9NRJ5 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PAPOLBQ9NRJ5 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PAPOLBQ9NRJ5 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PAPOLBQ9NRJ5 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PAPOLBQ9NRJ5 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105.5 ms