Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPR2

SEMA4B, Semaphorin-4B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 832 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4BQ9NPR2 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SEMA4BQ9NPR2 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SEMA4BQ9NPR2 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
SEMA4BQ9NPR2 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SEMA4BQ9NPR2 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SEMA4BQ9NPR2 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SEMA4BQ9NPR2 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SEMA4BQ9NPR2 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SEMA4BQ9NPR2 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SEMA4BQ9NPR2 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SEMA4BQ9NPR2 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SEMA4BQ9NPR2 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SEMA4BQ9NPR2 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SEMA4BQ9NPR2 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SEMA4BQ9NPR2 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SEMA4BQ9NPR2 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SEMA4BQ9NPR2 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SEMA4BQ9NPR2 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SEMA4BQ9NPR2 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SEMA4BQ9NPR2 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SEMA4BQ9NPR2 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SEMA4BQ9NPR2 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SEMA4BQ9NPR2 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SEMA4BQ9NPR2 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SEMA4BQ9NPR2 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SEMA4BQ9NPR2 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SEMA4BQ9NPR2 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SEMA4BQ9NPR2 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SEMA4BQ9NPR2 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SEMA4BQ9NPR2 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SEMA4BQ9NPR2 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SEMA4BQ9NPR2 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SEMA4BQ9NPR2 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SEMA4BQ9NPR2 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SEMA4BQ9NPR2 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SEMA4BQ9NPR2 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SEMA4BQ9NPR2 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SEMA4BQ9NPR2 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SEMA4BQ9NPR2 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SEMA4BQ9NPR2 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SEMA4BQ9NPR2 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SEMA4BQ9NPR2 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SEMA4BQ9NPR2 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
SEMA4BQ9NPR2 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SEMA4BQ9NPR2 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SEMA4BQ9NPR2 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SEMA4BQ9NPR2 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SEMA4BQ9NPR2 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SEMA4BQ9NPR2 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SEMA4BQ9NPR2 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SEMA4BQ9NPR2 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SEMA4BQ9NPR2 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SEMA4BQ9NPR2 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SEMA4BQ9NPR2 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SEMA4BQ9NPR2 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SEMA4BQ9NPR2 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SEMA4BQ9NPR2 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SEMA4BQ9NPR2 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SEMA4BQ9NPR2 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SEMA4BQ9NPR2 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SEMA4BQ9NPR2 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
SEMA4BQ9NPR2 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SEMA4BQ9NPR2 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SEMA4BQ9NPR2 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SEMA4BQ9NPR2 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SEMA4BQ9NPR2 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SEMA4BQ9NPR2 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SEMA4BQ9NPR2 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SEMA4BQ9NPR2 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SEMA4BQ9NPR2 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SEMA4BQ9NPR2 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
SEMA4BQ9NPR2 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SEMA4BQ9NPR2 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SEMA4BQ9NPR2 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SEMA4BQ9NPR2 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SEMA4BQ9NPR2 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SEMA4BQ9NPR2 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SEMA4BQ9NPR2 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SEMA4BQ9NPR2 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SEMA4BQ9NPR2 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SEMA4BQ9NPR2 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SEMA4BQ9NPR2 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
SEMA4BQ9NPR2 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SEMA4BQ9NPR2 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SEMA4BQ9NPR2 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SEMA4BQ9NPR2 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SEMA4BQ9NPR2 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SEMA4BQ9NPR2 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SEMA4BQ9NPR2 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SEMA4BQ9NPR2 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SEMA4BQ9NPR2 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SEMA4BQ9NPR2 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SEMA4BQ9NPR2 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SEMA4BQ9NPR2 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SEMA4BQ9NPR2 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SEMA4BQ9NPR2 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SEMA4BQ9NPR2 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SEMA4BQ9NPR2 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
SEMA4BQ9NPR2 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SEMA4BQ9NPR2 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.9 ms