Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP74

PALMD, Palmdelphin, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PALMDQ9NP74 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PALMDQ9NP74 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PALMDQ9NP74 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PALMDQ9NP74 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PALMDQ9NP74 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PALMDQ9NP74 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PALMDQ9NP74 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
PALMDQ9NP74 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PALMDQ9NP74 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PALMDQ9NP74 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PALMDQ9NP74 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PALMDQ9NP74 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PALMDQ9NP74 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PALMDQ9NP74 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PALMDQ9NP74 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PALMDQ9NP74 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PALMDQ9NP74 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PALMDQ9NP74 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PALMDQ9NP74 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PALMDQ9NP74 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PALMDQ9NP74 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PALMDQ9NP74 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PALMDQ9NP74 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PALMDQ9NP74 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PALMDQ9NP74 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PALMDQ9NP74 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PALMDQ9NP74 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
PALMDQ9NP74 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PALMDQ9NP74 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PALMDQ9NP74 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PALMDQ9NP74 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PALMDQ9NP74 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PALMDQ9NP74 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PALMDQ9NP74 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PALMDQ9NP74 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PALMDQ9NP74 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PALMDQ9NP74 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PALMDQ9NP74 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PALMDQ9NP74 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PALMDQ9NP74 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PALMDQ9NP74 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PALMDQ9NP74 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PALMDQ9NP74 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PALMDQ9NP74 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PALMDQ9NP74 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PALMDQ9NP74 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PALMDQ9NP74 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PALMDQ9NP74 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PALMDQ9NP74 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PALMDQ9NP74 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PALMDQ9NP74 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PALMDQ9NP74 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PALMDQ9NP74 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PALMDQ9NP74 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PALMDQ9NP74 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PALMDQ9NP74 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PALMDQ9NP74 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
PALMDQ9NP74 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PALMDQ9NP74 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PALMDQ9NP74 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PALMDQ9NP74 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PALMDQ9NP74 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PALMDQ9NP74 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
PALMDQ9NP74 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
PALMDQ9NP74 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PALMDQ9NP74 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PALMDQ9NP74 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PALMDQ9NP74 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PALMDQ9NP74 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PALMDQ9NP74 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PALMDQ9NP74 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PALMDQ9NP74 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PALMDQ9NP74 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PALMDQ9NP74 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PALMDQ9NP74 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PALMDQ9NP74 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PALMDQ9NP74 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PALMDQ9NP74 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PALMDQ9NP74 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PALMDQ9NP74 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PALMDQ9NP74 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PALMDQ9NP74 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PALMDQ9NP74 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PALMDQ9NP74 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PALMDQ9NP74 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PALMDQ9NP74 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PALMDQ9NP74 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PALMDQ9NP74 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PALMDQ9NP74 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PALMDQ9NP74 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PALMDQ9NP74 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PALMDQ9NP74 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PALMDQ9NP74 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PALMDQ9NP74 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PALMDQ9NP74 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PALMDQ9NP74 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PALMDQ9NP74 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PALMDQ9NP74 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PALMDQ9NP74 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PALMDQ9NP74 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.9 ms