Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBJ7

USP29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, humanhuman

Predictions only

Length 922 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP29Q9HBJ7 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
USP29Q9HBJ7 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC25.96■■□□□ 1.75
USP29Q9HBJ7 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
USP29Q9HBJ7 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
USP29Q9HBJ7 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
USP29Q9HBJ7 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
USP29Q9HBJ7 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
USP29Q9HBJ7 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
USP29Q9HBJ7 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
USP29Q9HBJ7 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
USP29Q9HBJ7 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
USP29Q9HBJ7 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
USP29Q9HBJ7 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
USP29Q9HBJ7 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
USP29Q9HBJ7 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
USP29Q9HBJ7 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
USP29Q9HBJ7 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
USP29Q9HBJ7 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
USP29Q9HBJ7 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
USP29Q9HBJ7 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
USP29Q9HBJ7 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
USP29Q9HBJ7 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
USP29Q9HBJ7 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
USP29Q9HBJ7 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
USP29Q9HBJ7 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
USP29Q9HBJ7 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
USP29Q9HBJ7 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
USP29Q9HBJ7 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
USP29Q9HBJ7 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
USP29Q9HBJ7 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
USP29Q9HBJ7 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
USP29Q9HBJ7 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
USP29Q9HBJ7 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
USP29Q9HBJ7 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
USP29Q9HBJ7 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
USP29Q9HBJ7 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
USP29Q9HBJ7 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
USP29Q9HBJ7 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
USP29Q9HBJ7 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
USP29Q9HBJ7 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
USP29Q9HBJ7 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
USP29Q9HBJ7 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
USP29Q9HBJ7 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
USP29Q9HBJ7 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.89■■□□□ 1.74
USP29Q9HBJ7 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
USP29Q9HBJ7 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
USP29Q9HBJ7 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
USP29Q9HBJ7 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
USP29Q9HBJ7 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
USP29Q9HBJ7 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
USP29Q9HBJ7 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC25.88■■□□□ 1.73
USP29Q9HBJ7 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
USP29Q9HBJ7 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
USP29Q9HBJ7 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
USP29Q9HBJ7 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
USP29Q9HBJ7 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
USP29Q9HBJ7 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
USP29Q9HBJ7 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
USP29Q9HBJ7 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
USP29Q9HBJ7 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
USP29Q9HBJ7 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
USP29Q9HBJ7 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
USP29Q9HBJ7 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
USP29Q9HBJ7 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
USP29Q9HBJ7 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
USP29Q9HBJ7 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
USP29Q9HBJ7 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
USP29Q9HBJ7 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
USP29Q9HBJ7 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
USP29Q9HBJ7 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
USP29Q9HBJ7 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
USP29Q9HBJ7 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
USP29Q9HBJ7 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
USP29Q9HBJ7 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
USP29Q9HBJ7 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
USP29Q9HBJ7 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
USP29Q9HBJ7 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
USP29Q9HBJ7 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
USP29Q9HBJ7 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
USP29Q9HBJ7 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
USP29Q9HBJ7 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
USP29Q9HBJ7 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
USP29Q9HBJ7 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
USP29Q9HBJ7 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
USP29Q9HBJ7 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
USP29Q9HBJ7 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
USP29Q9HBJ7 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
USP29Q9HBJ7 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
USP29Q9HBJ7 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
USP29Q9HBJ7 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
USP29Q9HBJ7 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
USP29Q9HBJ7 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
USP29Q9HBJ7 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
USP29Q9HBJ7 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
USP29Q9HBJ7 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
USP29Q9HBJ7 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
USP29Q9HBJ7 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
USP29Q9HBJ7 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
USP29Q9HBJ7 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
USP29Q9HBJ7 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 142 ms