Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q04

LMTK3, Serine/threonine-protein kinase LMTK3, humanhuman

Predictions only

Length 1,460 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMTK3Q96Q04 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.46■■■■□ 3.59
LMTK3Q96Q04 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
LMTK3Q96Q04 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.46■■■■□ 3.59
LMTK3Q96Q04 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC37.45■■■■□ 3.59
LMTK3Q96Q04 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC37.45■■■■□ 3.59
LMTK3Q96Q04 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.59
LMTK3Q96Q04 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.45■■■■□ 3.59
LMTK3Q96Q04 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC37.44■■■■□ 3.58
LMTK3Q96Q04 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC37.44■■■■□ 3.58
LMTK3Q96Q04 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC37.44■■■■□ 3.58
LMTK3Q96Q04 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC37.43■■■■□ 3.58
LMTK3Q96Q04 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC37.43■■■■□ 3.58
LMTK3Q96Q04 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC37.43■■■■□ 3.58
LMTK3Q96Q04 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
LMTK3Q96Q04 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC37.42■■■■□ 3.58
LMTK3Q96Q04 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC37.42■■■■□ 3.58
LMTK3Q96Q04 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC37.41■■■■□ 3.58
LMTK3Q96Q04 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
LMTK3Q96Q04 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC37.4■■■■□ 3.58
LMTK3Q96Q04 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.39■■■■□ 3.58
LMTK3Q96Q04 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
LMTK3Q96Q04 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
LMTK3Q96Q04 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC37.39■■■■□ 3.58
LMTK3Q96Q04 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
LMTK3Q96Q04 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC37.39■■■■□ 3.58
LMTK3Q96Q04 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC37.39■■■■□ 3.58
LMTK3Q96Q04 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC37.38■■■■□ 3.57
LMTK3Q96Q04 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.57
LMTK3Q96Q04 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.37■■■■□ 3.57
LMTK3Q96Q04 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC37.37■■■■□ 3.57
LMTK3Q96Q04 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC37.37■■■■□ 3.57
LMTK3Q96Q04 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC37.37■■■■□ 3.57
LMTK3Q96Q04 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
LMTK3Q96Q04 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
LMTK3Q96Q04 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.35■■■■□ 3.57
LMTK3Q96Q04 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.34■■■■□ 3.57
LMTK3Q96Q04 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
LMTK3Q96Q04 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC37.33■■■■□ 3.57
LMTK3Q96Q04 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.33■■■■□ 3.57
LMTK3Q96Q04 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
LMTK3Q96Q04 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.56
LMTK3Q96Q04 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.56
LMTK3Q96Q04 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.56
LMTK3Q96Q04 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.31■■■■□ 3.56
LMTK3Q96Q04 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC37.3■■■■□ 3.56
LMTK3Q96Q04 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.3■■■■□ 3.56
LMTK3Q96Q04 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
LMTK3Q96Q04 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
LMTK3Q96Q04 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
LMTK3Q96Q04 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
LMTK3Q96Q04 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.29■■■■□ 3.56
LMTK3Q96Q04 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC37.28■■■■□ 3.56
LMTK3Q96Q04 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC37.28■■■■□ 3.56
LMTK3Q96Q04 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC37.27■■■■□ 3.56
LMTK3Q96Q04 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC37.27■■■■□ 3.56
LMTK3Q96Q04 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC37.26■■■■□ 3.56
LMTK3Q96Q04 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC37.26■■■■□ 3.55
LMTK3Q96Q04 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC37.26■■■■□ 3.55
LMTK3Q96Q04 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC37.26■■■■□ 3.55
LMTK3Q96Q04 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
LMTK3Q96Q04 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.25■■■■□ 3.55
LMTK3Q96Q04 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
LMTK3Q96Q04 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
LMTK3Q96Q04 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC37.23■■■■□ 3.55
LMTK3Q96Q04 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.23■■■■□ 3.55
LMTK3Q96Q04 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC37.23■■■■□ 3.55
LMTK3Q96Q04 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC37.22■■■■□ 3.55
LMTK3Q96Q04 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
LMTK3Q96Q04 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC37.21■■■■□ 3.55
LMTK3Q96Q04 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
LMTK3Q96Q04 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
LMTK3Q96Q04 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC37.2■■■■□ 3.55
LMTK3Q96Q04 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC37.2■■■■□ 3.55
LMTK3Q96Q04 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.2■■■■□ 3.55
LMTK3Q96Q04 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.2■■■■□ 3.55
LMTK3Q96Q04 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
LMTK3Q96Q04 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.54
LMTK3Q96Q04 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
LMTK3Q96Q04 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
LMTK3Q96Q04 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
LMTK3Q96Q04 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
LMTK3Q96Q04 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC37.19■■■■□ 3.54
LMTK3Q96Q04 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC37.19■■■■□ 3.54
LMTK3Q96Q04 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
LMTK3Q96Q04 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.18■■■■□ 3.54
LMTK3Q96Q04 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
LMTK3Q96Q04 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC37.17■■■■□ 3.54
LMTK3Q96Q04 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC37.17■■■■□ 3.54
LMTK3Q96Q04 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC37.17■■■■□ 3.54
LMTK3Q96Q04 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC37.17■■■■□ 3.54
LMTK3Q96Q04 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC37.16■■■■□ 3.54
LMTK3Q96Q04 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
LMTK3Q96Q04 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.54
LMTK3Q96Q04 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC37.13■■■■□ 3.54
LMTK3Q96Q04 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC37.13■■■■□ 3.54
LMTK3Q96Q04 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.13■■■■□ 3.53
LMTK3Q96Q04 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
LMTK3Q96Q04 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
LMTK3Q96Q04 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
LMTK3Q96Q04 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms