Protein–RNA interactions for Protein: Q96NM4

TOX2, TOX high mobility group box family member 2, humanhuman

Predictions only

Length 488 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOX2Q96NM4 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TOX2Q96NM4 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
TOX2Q96NM4 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
TOX2Q96NM4 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.04■■■□□ 2.08
TOX2Q96NM4 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TOX2Q96NM4 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TOX2Q96NM4 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TOX2Q96NM4 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TOX2Q96NM4 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
TOX2Q96NM4 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TOX2Q96NM4 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TOX2Q96NM4 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TOX2Q96NM4 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TOX2Q96NM4 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TOX2Q96NM4 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TOX2Q96NM4 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TOX2Q96NM4 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
TOX2Q96NM4 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TOX2Q96NM4 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
TOX2Q96NM4 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
TOX2Q96NM4 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
TOX2Q96NM4 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
TOX2Q96NM4 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TOX2Q96NM4 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TOX2Q96NM4 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
TOX2Q96NM4 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TOX2Q96NM4 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TOX2Q96NM4 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TOX2Q96NM4 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TOX2Q96NM4 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
TOX2Q96NM4 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
TOX2Q96NM4 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TOX2Q96NM4 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TOX2Q96NM4 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TOX2Q96NM4 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TOX2Q96NM4 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
TOX2Q96NM4 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
TOX2Q96NM4 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
TOX2Q96NM4 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
TOX2Q96NM4 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
TOX2Q96NM4 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
TOX2Q96NM4 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
TOX2Q96NM4 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
TOX2Q96NM4 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
TOX2Q96NM4 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
TOX2Q96NM4 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
TOX2Q96NM4 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
TOX2Q96NM4 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
TOX2Q96NM4 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
TOX2Q96NM4 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
TOX2Q96NM4 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC27.93■■■□□ 2.06
TOX2Q96NM4 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
TOX2Q96NM4 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TOX2Q96NM4 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC27.92■■■□□ 2.06
TOX2Q96NM4 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
TOX2Q96NM4 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
TOX2Q96NM4 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
TOX2Q96NM4 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
TOX2Q96NM4 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
TOX2Q96NM4 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC27.9■■■□□ 2.06
TOX2Q96NM4 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
TOX2Q96NM4 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
TOX2Q96NM4 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
TOX2Q96NM4 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
TOX2Q96NM4 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
TOX2Q96NM4 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
TOX2Q96NM4 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
TOX2Q96NM4 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
TOX2Q96NM4 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
TOX2Q96NM4 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
TOX2Q96NM4 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
TOX2Q96NM4 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
TOX2Q96NM4 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TOX2Q96NM4 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
TOX2Q96NM4 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TOX2Q96NM4 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
TOX2Q96NM4 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TOX2Q96NM4 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TOX2Q96NM4 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
TOX2Q96NM4 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
TOX2Q96NM4 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
TOX2Q96NM4 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
TOX2Q96NM4 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
TOX2Q96NM4 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
TOX2Q96NM4 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
TOX2Q96NM4 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC27.82■■■□□ 2.04
TOX2Q96NM4 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TOX2Q96NM4 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
TOX2Q96NM4 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
TOX2Q96NM4 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TOX2Q96NM4 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
TOX2Q96NM4 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
TOX2Q96NM4 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
TOX2Q96NM4 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
TOX2Q96NM4 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
TOX2Q96NM4 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
TOX2Q96NM4 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TOX2Q96NM4 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
TOX2Q96NM4 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
TOX2Q96NM4 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 203 ms