Protein–RNA interactions for Protein: Q96MU6

ZNF778, Zinc finger protein 778, humanhuman

Predictions only

Length 729 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF778Q96MU6 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ZNF778Q96MU6 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ZNF778Q96MU6 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ZNF778Q96MU6 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ZNF778Q96MU6 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ZNF778Q96MU6 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ZNF778Q96MU6 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ZNF778Q96MU6 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ZNF778Q96MU6 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ZNF778Q96MU6 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
ZNF778Q96MU6 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ZNF778Q96MU6 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ZNF778Q96MU6 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ZNF778Q96MU6 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ZNF778Q96MU6 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ZNF778Q96MU6 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
ZNF778Q96MU6 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ZNF778Q96MU6 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ZNF778Q96MU6 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ZNF778Q96MU6 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ZNF778Q96MU6 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ZNF778Q96MU6 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ZNF778Q96MU6 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ZNF778Q96MU6 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ZNF778Q96MU6 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ZNF778Q96MU6 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ZNF778Q96MU6 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ZNF778Q96MU6 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ZNF778Q96MU6 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ZNF778Q96MU6 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ZNF778Q96MU6 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ZNF778Q96MU6 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ZNF778Q96MU6 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ZNF778Q96MU6 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ZNF778Q96MU6 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ZNF778Q96MU6 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ZNF778Q96MU6 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ZNF778Q96MU6 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ZNF778Q96MU6 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ZNF778Q96MU6 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ZNF778Q96MU6 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ZNF778Q96MU6 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ZNF778Q96MU6 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ZNF778Q96MU6 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ZNF778Q96MU6 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ZNF778Q96MU6 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ZNF778Q96MU6 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ZNF778Q96MU6 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ZNF778Q96MU6 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ZNF778Q96MU6 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ZNF778Q96MU6 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ZNF778Q96MU6 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ZNF778Q96MU6 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ZNF778Q96MU6 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ZNF778Q96MU6 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ZNF778Q96MU6 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ZNF778Q96MU6 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ZNF778Q96MU6 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZNF778Q96MU6 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZNF778Q96MU6 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZNF778Q96MU6 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZNF778Q96MU6 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZNF778Q96MU6 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ZNF778Q96MU6 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ZNF778Q96MU6 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ZNF778Q96MU6 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
ZNF778Q96MU6 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ZNF778Q96MU6 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ZNF778Q96MU6 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ZNF778Q96MU6 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ZNF778Q96MU6 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ZNF778Q96MU6 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ZNF778Q96MU6 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
ZNF778Q96MU6 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ZNF778Q96MU6 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ZNF778Q96MU6 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ZNF778Q96MU6 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ZNF778Q96MU6 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ZNF778Q96MU6 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ZNF778Q96MU6 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ZNF778Q96MU6 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ZNF778Q96MU6 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ZNF778Q96MU6 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ZNF778Q96MU6 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ZNF778Q96MU6 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ZNF778Q96MU6 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ZNF778Q96MU6 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ZNF778Q96MU6 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ZNF778Q96MU6 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ZNF778Q96MU6 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ZNF778Q96MU6 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ZNF778Q96MU6 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ZNF778Q96MU6 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
ZNF778Q96MU6 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ZNF778Q96MU6 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ZNF778Q96MU6 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ZNF778Q96MU6 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ZNF778Q96MU6 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ZNF778Q96MU6 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ZNF778Q96MU6 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.9 ms