Protein–RNA interactions for Protein: Q96IQ7

VSIG2, V-set and immunoglobulin domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 327 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSIG2Q96IQ7 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
VSIG2Q96IQ7 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
VSIG2Q96IQ7 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
VSIG2Q96IQ7 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
VSIG2Q96IQ7 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
VSIG2Q96IQ7 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
VSIG2Q96IQ7 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
VSIG2Q96IQ7 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
VSIG2Q96IQ7 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
VSIG2Q96IQ7 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
VSIG2Q96IQ7 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
VSIG2Q96IQ7 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
VSIG2Q96IQ7 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
VSIG2Q96IQ7 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
VSIG2Q96IQ7 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
VSIG2Q96IQ7 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
VSIG2Q96IQ7 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
VSIG2Q96IQ7 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
VSIG2Q96IQ7 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
VSIG2Q96IQ7 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
VSIG2Q96IQ7 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
VSIG2Q96IQ7 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
VSIG2Q96IQ7 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
VSIG2Q96IQ7 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
VSIG2Q96IQ7 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
VSIG2Q96IQ7 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
VSIG2Q96IQ7 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
VSIG2Q96IQ7 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
VSIG2Q96IQ7 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
VSIG2Q96IQ7 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
VSIG2Q96IQ7 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
VSIG2Q96IQ7 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
VSIG2Q96IQ7 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
VSIG2Q96IQ7 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
VSIG2Q96IQ7 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
VSIG2Q96IQ7 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
VSIG2Q96IQ7 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
VSIG2Q96IQ7 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
VSIG2Q96IQ7 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
VSIG2Q96IQ7 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
VSIG2Q96IQ7 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.45
VSIG2Q96IQ7 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
VSIG2Q96IQ7 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
VSIG2Q96IQ7 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
VSIG2Q96IQ7 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
VSIG2Q96IQ7 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
VSIG2Q96IQ7 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
VSIG2Q96IQ7 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
VSIG2Q96IQ7 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
VSIG2Q96IQ7 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
VSIG2Q96IQ7 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
VSIG2Q96IQ7 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
VSIG2Q96IQ7 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
VSIG2Q96IQ7 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
VSIG2Q96IQ7 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
VSIG2Q96IQ7 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
VSIG2Q96IQ7 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
VSIG2Q96IQ7 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
VSIG2Q96IQ7 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
VSIG2Q96IQ7 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
VSIG2Q96IQ7 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
VSIG2Q96IQ7 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
VSIG2Q96IQ7 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
VSIG2Q96IQ7 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
VSIG2Q96IQ7 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
VSIG2Q96IQ7 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
VSIG2Q96IQ7 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
VSIG2Q96IQ7 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
VSIG2Q96IQ7 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
VSIG2Q96IQ7 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
VSIG2Q96IQ7 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
VSIG2Q96IQ7 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
VSIG2Q96IQ7 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
VSIG2Q96IQ7 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
VSIG2Q96IQ7 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
VSIG2Q96IQ7 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
VSIG2Q96IQ7 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
VSIG2Q96IQ7 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
VSIG2Q96IQ7 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
VSIG2Q96IQ7 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
VSIG2Q96IQ7 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
VSIG2Q96IQ7 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
VSIG2Q96IQ7 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
VSIG2Q96IQ7 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
VSIG2Q96IQ7 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
VSIG2Q96IQ7 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
VSIG2Q96IQ7 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
VSIG2Q96IQ7 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
VSIG2Q96IQ7 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
VSIG2Q96IQ7 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
VSIG2Q96IQ7 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
VSIG2Q96IQ7 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
VSIG2Q96IQ7 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
VSIG2Q96IQ7 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
VSIG2Q96IQ7 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
VSIG2Q96IQ7 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
VSIG2Q96IQ7 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
VSIG2Q96IQ7 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
VSIG2Q96IQ7 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
VSIG2Q96IQ7 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60 ms