Protein–RNA interactions for Protein: Q96HF1

SFRP2, Secreted frizzled-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 295 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFRP2Q96HF1 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SFRP2Q96HF1 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SFRP2Q96HF1 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SFRP2Q96HF1 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SFRP2Q96HF1 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SFRP2Q96HF1 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SFRP2Q96HF1 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SFRP2Q96HF1 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SFRP2Q96HF1 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SFRP2Q96HF1 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SFRP2Q96HF1 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SFRP2Q96HF1 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SFRP2Q96HF1 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SFRP2Q96HF1 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SFRP2Q96HF1 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SFRP2Q96HF1 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SFRP2Q96HF1 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SFRP2Q96HF1 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SFRP2Q96HF1 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SFRP2Q96HF1 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SFRP2Q96HF1 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SFRP2Q96HF1 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SFRP2Q96HF1 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SFRP2Q96HF1 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SFRP2Q96HF1 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SFRP2Q96HF1 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SFRP2Q96HF1 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SFRP2Q96HF1 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SFRP2Q96HF1 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SFRP2Q96HF1 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SFRP2Q96HF1 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SFRP2Q96HF1 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SFRP2Q96HF1 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SFRP2Q96HF1 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SFRP2Q96HF1 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SFRP2Q96HF1 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SFRP2Q96HF1 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SFRP2Q96HF1 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SFRP2Q96HF1 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SFRP2Q96HF1 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SFRP2Q96HF1 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SFRP2Q96HF1 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SFRP2Q96HF1 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SFRP2Q96HF1 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SFRP2Q96HF1 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SFRP2Q96HF1 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SFRP2Q96HF1 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
SFRP2Q96HF1 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SFRP2Q96HF1 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SFRP2Q96HF1 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SFRP2Q96HF1 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SFRP2Q96HF1 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SFRP2Q96HF1 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SFRP2Q96HF1 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SFRP2Q96HF1 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SFRP2Q96HF1 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SFRP2Q96HF1 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SFRP2Q96HF1 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SFRP2Q96HF1 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SFRP2Q96HF1 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SFRP2Q96HF1 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SFRP2Q96HF1 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SFRP2Q96HF1 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SFRP2Q96HF1 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SFRP2Q96HF1 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SFRP2Q96HF1 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SFRP2Q96HF1 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SFRP2Q96HF1 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SFRP2Q96HF1 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SFRP2Q96HF1 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SFRP2Q96HF1 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SFRP2Q96HF1 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SFRP2Q96HF1 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SFRP2Q96HF1 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SFRP2Q96HF1 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SFRP2Q96HF1 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SFRP2Q96HF1 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SFRP2Q96HF1 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SFRP2Q96HF1 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
SFRP2Q96HF1 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SFRP2Q96HF1 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SFRP2Q96HF1 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SFRP2Q96HF1 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
SFRP2Q96HF1 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SFRP2Q96HF1 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SFRP2Q96HF1 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SFRP2Q96HF1 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SFRP2Q96HF1 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SFRP2Q96HF1 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SFRP2Q96HF1 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SFRP2Q96HF1 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SFRP2Q96HF1 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SFRP2Q96HF1 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SFRP2Q96HF1 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SFRP2Q96HF1 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SFRP2Q96HF1 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SFRP2Q96HF1 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
SFRP2Q96HF1 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SFRP2Q96HF1 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SFRP2Q96HF1 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.3 ms