Protein–RNA interactions for Protein: Q96ES7

SGF29, SAGA-associated factor 29, humanhuman

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Length 293 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGF29Q96ES7 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SGF29Q96ES7 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SGF29Q96ES7 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SGF29Q96ES7 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SGF29Q96ES7 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SGF29Q96ES7 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
SGF29Q96ES7 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SGF29Q96ES7 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SGF29Q96ES7 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SGF29Q96ES7 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SGF29Q96ES7 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SGF29Q96ES7 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SGF29Q96ES7 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
SGF29Q96ES7 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
SGF29Q96ES7 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
SGF29Q96ES7 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
SGF29Q96ES7 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
SGF29Q96ES7 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
SGF29Q96ES7 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
SGF29Q96ES7 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
SGF29Q96ES7 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
SGF29Q96ES7 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SGF29Q96ES7 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SGF29Q96ES7 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SGF29Q96ES7 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SGF29Q96ES7 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SGF29Q96ES7 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SGF29Q96ES7 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SGF29Q96ES7 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SGF29Q96ES7 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SGF29Q96ES7 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SGF29Q96ES7 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SGF29Q96ES7 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SGF29Q96ES7 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SGF29Q96ES7 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SGF29Q96ES7 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SGF29Q96ES7 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SGF29Q96ES7 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SGF29Q96ES7 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SGF29Q96ES7 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
SGF29Q96ES7 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SGF29Q96ES7 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SGF29Q96ES7 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SGF29Q96ES7 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SGF29Q96ES7 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SGF29Q96ES7 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SGF29Q96ES7 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SGF29Q96ES7 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SGF29Q96ES7 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SGF29Q96ES7 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SGF29Q96ES7 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SGF29Q96ES7 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SGF29Q96ES7 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
SGF29Q96ES7 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SGF29Q96ES7 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SGF29Q96ES7 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
SGF29Q96ES7 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SGF29Q96ES7 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SGF29Q96ES7 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SGF29Q96ES7 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SGF29Q96ES7 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SGF29Q96ES7 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SGF29Q96ES7 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SGF29Q96ES7 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SGF29Q96ES7 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SGF29Q96ES7 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SGF29Q96ES7 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SGF29Q96ES7 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SGF29Q96ES7 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SGF29Q96ES7 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SGF29Q96ES7 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SGF29Q96ES7 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SGF29Q96ES7 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SGF29Q96ES7 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SGF29Q96ES7 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SGF29Q96ES7 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SGF29Q96ES7 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SGF29Q96ES7 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SGF29Q96ES7 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SGF29Q96ES7 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SGF29Q96ES7 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SGF29Q96ES7 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SGF29Q96ES7 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SGF29Q96ES7 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SGF29Q96ES7 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
SGF29Q96ES7 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SGF29Q96ES7 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
SGF29Q96ES7 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SGF29Q96ES7 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SGF29Q96ES7 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SGF29Q96ES7 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SGF29Q96ES7 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SGF29Q96ES7 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.6
SGF29Q96ES7 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.6
SGF29Q96ES7 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SGF29Q96ES7 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SGF29Q96ES7 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SGF29Q96ES7 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SGF29Q96ES7 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SGF29Q96ES7 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
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