Protein–RNA interactions for Protein: Q96BW1

UPRT, Uracil phosphoribosyltransferase homolog, humanhuman

Predictions only

Length 309 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPRTQ96BW1 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
UPRTQ96BW1 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
UPRTQ96BW1 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
UPRTQ96BW1 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
UPRTQ96BW1 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
UPRTQ96BW1 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
UPRTQ96BW1 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
UPRTQ96BW1 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
UPRTQ96BW1 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
UPRTQ96BW1 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
UPRTQ96BW1 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
UPRTQ96BW1 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
UPRTQ96BW1 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
UPRTQ96BW1 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
UPRTQ96BW1 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
UPRTQ96BW1 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
UPRTQ96BW1 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
UPRTQ96BW1 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
UPRTQ96BW1 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
UPRTQ96BW1 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
UPRTQ96BW1 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
UPRTQ96BW1 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
UPRTQ96BW1 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
UPRTQ96BW1 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
UPRTQ96BW1 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
UPRTQ96BW1 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
UPRTQ96BW1 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
UPRTQ96BW1 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
UPRTQ96BW1 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
UPRTQ96BW1 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
UPRTQ96BW1 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
UPRTQ96BW1 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
UPRTQ96BW1 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
UPRTQ96BW1 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
UPRTQ96BW1 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
UPRTQ96BW1 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
UPRTQ96BW1 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
UPRTQ96BW1 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
UPRTQ96BW1 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
UPRTQ96BW1 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
UPRTQ96BW1 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
UPRTQ96BW1 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
UPRTQ96BW1 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
UPRTQ96BW1 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
UPRTQ96BW1 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
UPRTQ96BW1 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
UPRTQ96BW1 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
UPRTQ96BW1 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
UPRTQ96BW1 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
UPRTQ96BW1 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
UPRTQ96BW1 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
UPRTQ96BW1 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
UPRTQ96BW1 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
UPRTQ96BW1 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
UPRTQ96BW1 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
UPRTQ96BW1 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
UPRTQ96BW1 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
UPRTQ96BW1 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
UPRTQ96BW1 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
UPRTQ96BW1 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
UPRTQ96BW1 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
UPRTQ96BW1 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
UPRTQ96BW1 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
UPRTQ96BW1 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
UPRTQ96BW1 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
UPRTQ96BW1 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
UPRTQ96BW1 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
UPRTQ96BW1 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
UPRTQ96BW1 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
UPRTQ96BW1 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
UPRTQ96BW1 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
UPRTQ96BW1 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
UPRTQ96BW1 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
UPRTQ96BW1 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
UPRTQ96BW1 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
UPRTQ96BW1 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
UPRTQ96BW1 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
UPRTQ96BW1 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
UPRTQ96BW1 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
UPRTQ96BW1 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
UPRTQ96BW1 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
UPRTQ96BW1 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
UPRTQ96BW1 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
UPRTQ96BW1 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
UPRTQ96BW1 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
UPRTQ96BW1 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
UPRTQ96BW1 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
UPRTQ96BW1 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
UPRTQ96BW1 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
UPRTQ96BW1 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
UPRTQ96BW1 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
UPRTQ96BW1 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
UPRTQ96BW1 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
UPRTQ96BW1 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
UPRTQ96BW1 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
UPRTQ96BW1 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
UPRTQ96BW1 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
UPRTQ96BW1 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
UPRTQ96BW1 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
UPRTQ96BW1 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.1 ms