Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWT9

SLC13A3, Solute carrier family 13 member 3, humanhuman

Predictions only

Length 602 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC13A3Q8WWT9 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC13A3Q8WWT9 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC13A3Q8WWT9 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC13A3Q8WWT9 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC13A3Q8WWT9 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC13A3Q8WWT9 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SLC13A3Q8WWT9 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SLC13A3Q8WWT9 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
SLC13A3Q8WWT9 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SLC13A3Q8WWT9 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
SLC13A3Q8WWT9 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
SLC13A3Q8WWT9 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
SLC13A3Q8WWT9 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
SLC13A3Q8WWT9 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
SLC13A3Q8WWT9 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
SLC13A3Q8WWT9 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
SLC13A3Q8WWT9 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
SLC13A3Q8WWT9 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SLC13A3Q8WWT9 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC13A3Q8WWT9 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC13A3Q8WWT9 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC13A3Q8WWT9 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC13A3Q8WWT9 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC13A3Q8WWT9 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC13A3Q8WWT9 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC13A3Q8WWT9 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC13A3Q8WWT9 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC13A3Q8WWT9 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC13A3Q8WWT9 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC13A3Q8WWT9 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC13A3Q8WWT9 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC13A3Q8WWT9 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC13A3Q8WWT9 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC13A3Q8WWT9 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC13A3Q8WWT9 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC13A3Q8WWT9 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC13A3Q8WWT9 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC13A3Q8WWT9 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC13A3Q8WWT9 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC13A3Q8WWT9 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC13A3Q8WWT9 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC13A3Q8WWT9 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SLC13A3Q8WWT9 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SLC13A3Q8WWT9 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
SLC13A3Q8WWT9 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
SLC13A3Q8WWT9 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC13A3Q8WWT9 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC13A3Q8WWT9 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC13A3Q8WWT9 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC13A3Q8WWT9 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC13A3Q8WWT9 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC13A3Q8WWT9 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC13A3Q8WWT9 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC13A3Q8WWT9 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC13A3Q8WWT9 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC13A3Q8WWT9 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC13A3Q8WWT9 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC13A3Q8WWT9 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC13A3Q8WWT9 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC13A3Q8WWT9 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC13A3Q8WWT9 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC13A3Q8WWT9 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC13A3Q8WWT9 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC13A3Q8WWT9 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC13A3Q8WWT9 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC13A3Q8WWT9 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC13A3Q8WWT9 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC13A3Q8WWT9 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC13A3Q8WWT9 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC13A3Q8WWT9 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC13A3Q8WWT9 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC13A3Q8WWT9 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC13A3Q8WWT9 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC13A3Q8WWT9 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC13A3Q8WWT9 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC13A3Q8WWT9 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC13A3Q8WWT9 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC13A3Q8WWT9 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC13A3Q8WWT9 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC13A3Q8WWT9 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC13A3Q8WWT9 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC13A3Q8WWT9 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC13A3Q8WWT9 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC13A3Q8WWT9 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC13A3Q8WWT9 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC13A3Q8WWT9 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC13A3Q8WWT9 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC13A3Q8WWT9 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC13A3Q8WWT9 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC13A3Q8WWT9 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC13A3Q8WWT9 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC13A3Q8WWT9 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC13A3Q8WWT9 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC13A3Q8WWT9 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC13A3Q8WWT9 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC13A3Q8WWT9 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC13A3Q8WWT9 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC13A3Q8WWT9 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC13A3Q8WWT9 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC13A3Q8WWT9 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 156.8 ms