Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDY2

RB1CC1, RB1-inducible coiled-coil protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RB1CC1Q8TDY2 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC49.84■■■■■ 5.57
RB1CC1Q8TDY2 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC49.84■■■■■ 5.57
RB1CC1Q8TDY2 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC49.84■■■■■ 5.57
RB1CC1Q8TDY2 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.82■■■■■ 5.57
RB1CC1Q8TDY2 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.82■■■■■ 5.57
RB1CC1Q8TDY2 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC49.81■■■■■ 5.56
RB1CC1Q8TDY2 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC49.81■■■■■ 5.56
RB1CC1Q8TDY2 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC49.8■■■■■ 5.56
RB1CC1Q8TDY2 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.79■■■■■ 5.56
RB1CC1Q8TDY2 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC49.79■■■■■ 5.56
RB1CC1Q8TDY2 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC49.78■■■■■ 5.56
RB1CC1Q8TDY2 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC49.78■■■■■ 5.56
RB1CC1Q8TDY2 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC49.78■■■■■ 5.56
RB1CC1Q8TDY2 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC49.78■■■■■ 5.56
RB1CC1Q8TDY2 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC49.78■■■■■ 5.56
RB1CC1Q8TDY2 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC49.76■■■■■ 5.56
RB1CC1Q8TDY2 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC49.76■■■■■ 5.56
RB1CC1Q8TDY2 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.76■■■■■ 5.56
RB1CC1Q8TDY2 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC49.75■■■■■ 5.56
RB1CC1Q8TDY2 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC49.75■■■■■ 5.56
RB1CC1Q8TDY2 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC49.75■■■■■ 5.55
RB1CC1Q8TDY2 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC49.75■■■■■ 5.55
RB1CC1Q8TDY2 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC49.75■■■■■ 5.55
RB1CC1Q8TDY2 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC49.75■■■■■ 5.55
RB1CC1Q8TDY2 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC49.75■■■■■ 5.55
RB1CC1Q8TDY2 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC49.75■■■■■ 5.55
RB1CC1Q8TDY2 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC49.74■■■■■ 5.55
RB1CC1Q8TDY2 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC49.74■■■■■ 5.55
RB1CC1Q8TDY2 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC49.73■■■■■ 5.55
RB1CC1Q8TDY2 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC49.73■■■■■ 5.55
RB1CC1Q8TDY2 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC49.73■■■■■ 5.55
RB1CC1Q8TDY2 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC49.73■■■■■ 5.55
RB1CC1Q8TDY2 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC49.73■■■■■ 5.55
RB1CC1Q8TDY2 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC49.71■■■■■ 5.55
RB1CC1Q8TDY2 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC49.71■■■■■ 5.55
RB1CC1Q8TDY2 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC49.7■■■■■ 5.55
RB1CC1Q8TDY2 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC49.7■■■■■ 5.55
RB1CC1Q8TDY2 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC49.7■■■■■ 5.55
RB1CC1Q8TDY2 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC49.69■■■■■ 5.55
RB1CC1Q8TDY2 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC49.69■■■■■ 5.54
RB1CC1Q8TDY2 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.69■■■■■ 5.54
RB1CC1Q8TDY2 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC49.68■■■■■ 5.54
RB1CC1Q8TDY2 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.67■■■■■ 5.54
RB1CC1Q8TDY2 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC49.67■■■■■ 5.54
RB1CC1Q8TDY2 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.66■■■■■ 5.54
RB1CC1Q8TDY2 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC49.66■■■■■ 5.54
RB1CC1Q8TDY2 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.64■■■■■ 5.54
RB1CC1Q8TDY2 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC49.64■■■■■ 5.54
RB1CC1Q8TDY2 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC49.64■■■■■ 5.54
RB1CC1Q8TDY2 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC49.64■■■■■ 5.54
RB1CC1Q8TDY2 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC49.63■■■■■ 5.54
RB1CC1Q8TDY2 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC49.62■■■■■ 5.53
RB1CC1Q8TDY2 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC49.62■■■■■ 5.53
RB1CC1Q8TDY2 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC49.62■■■■■ 5.53
RB1CC1Q8TDY2 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC49.62■■■■■ 5.53
RB1CC1Q8TDY2 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC49.62■■■■■ 5.53
RB1CC1Q8TDY2 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.61■■■■■ 5.53
RB1CC1Q8TDY2 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC49.61■■■■■ 5.53
RB1CC1Q8TDY2 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.6■■■■■ 5.53
RB1CC1Q8TDY2 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC49.6■■■■■ 5.53
RB1CC1Q8TDY2 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC49.6■■■■■ 5.53
RB1CC1Q8TDY2 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC49.6■■■■■ 5.53
RB1CC1Q8TDY2 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC49.6■■■■■ 5.53
RB1CC1Q8TDY2 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC49.59■■■■■ 5.53
RB1CC1Q8TDY2 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.59■■■■■ 5.53
RB1CC1Q8TDY2 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.59■■■■■ 5.53
RB1CC1Q8TDY2 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC49.58■■■■■ 5.53
RB1CC1Q8TDY2 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC49.57■■■■■ 5.53
RB1CC1Q8TDY2 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC49.55■■■■■ 5.52
RB1CC1Q8TDY2 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.54■■■■■ 5.52
RB1CC1Q8TDY2 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC49.53■■■■■ 5.52
RB1CC1Q8TDY2 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC49.52■■■■■ 5.52
RB1CC1Q8TDY2 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC49.51■■■■■ 5.52
RB1CC1Q8TDY2 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC49.51■■■■■ 5.52
RB1CC1Q8TDY2 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.5■■■■■ 5.52
RB1CC1Q8TDY2 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC49.5■■■■■ 5.51
RB1CC1Q8TDY2 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC49.49■■■■■ 5.51
RB1CC1Q8TDY2 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC49.49■■■■■ 5.51
RB1CC1Q8TDY2 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC49.49■■■■■ 5.51
RB1CC1Q8TDY2 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC49.49■■■■■ 5.51
RB1CC1Q8TDY2 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC49.48■■■■■ 5.51
RB1CC1Q8TDY2 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.48■■■■■ 5.51
RB1CC1Q8TDY2 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC49.47■■■■■ 5.51
RB1CC1Q8TDY2 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC49.46■■■■■ 5.51
RB1CC1Q8TDY2 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC49.46■■■■■ 5.51
RB1CC1Q8TDY2 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC49.46■■■■■ 5.51
RB1CC1Q8TDY2 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC49.46■■■■■ 5.51
RB1CC1Q8TDY2 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC49.46■■■■■ 5.51
RB1CC1Q8TDY2 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC49.45■■■■■ 5.51
RB1CC1Q8TDY2 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC49.45■■■■■ 5.51
RB1CC1Q8TDY2 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC49.45■■■■■ 5.51
RB1CC1Q8TDY2 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC49.45■■■■■ 5.51
RB1CC1Q8TDY2 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC49.45■■■■■ 5.51
RB1CC1Q8TDY2 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.44■■■■■ 5.51
RB1CC1Q8TDY2 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.44■■■■■ 5.5
RB1CC1Q8TDY2 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC49.43■■■■■ 5.5
RB1CC1Q8TDY2 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC49.43■■■■■ 5.5
RB1CC1Q8TDY2 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC49.42■■■■■ 5.5
RB1CC1Q8TDY2 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC49.42■■■■■ 5.5
RB1CC1Q8TDY2 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC49.41■■■■■ 5.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.7 ms