Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z5U6

WDR53, WD repeat-containing protein 53, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR53Q7Z5U6 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
WDR53Q7Z5U6 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
WDR53Q7Z5U6 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
WDR53Q7Z5U6 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
WDR53Q7Z5U6 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
WDR53Q7Z5U6 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
WDR53Q7Z5U6 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
WDR53Q7Z5U6 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
WDR53Q7Z5U6 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
WDR53Q7Z5U6 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
WDR53Q7Z5U6 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
WDR53Q7Z5U6 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
WDR53Q7Z5U6 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
WDR53Q7Z5U6 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
WDR53Q7Z5U6 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
WDR53Q7Z5U6 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
WDR53Q7Z5U6 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
WDR53Q7Z5U6 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
WDR53Q7Z5U6 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
WDR53Q7Z5U6 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
WDR53Q7Z5U6 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
WDR53Q7Z5U6 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
WDR53Q7Z5U6 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
WDR53Q7Z5U6 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
WDR53Q7Z5U6 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
WDR53Q7Z5U6 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
WDR53Q7Z5U6 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
WDR53Q7Z5U6 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
WDR53Q7Z5U6 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
WDR53Q7Z5U6 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
WDR53Q7Z5U6 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
WDR53Q7Z5U6 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
WDR53Q7Z5U6 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
WDR53Q7Z5U6 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
WDR53Q7Z5U6 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
WDR53Q7Z5U6 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
WDR53Q7Z5U6 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
WDR53Q7Z5U6 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
WDR53Q7Z5U6 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
WDR53Q7Z5U6 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
WDR53Q7Z5U6 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
WDR53Q7Z5U6 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
WDR53Q7Z5U6 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
WDR53Q7Z5U6 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
WDR53Q7Z5U6 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
WDR53Q7Z5U6 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
WDR53Q7Z5U6 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
WDR53Q7Z5U6 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
WDR53Q7Z5U6 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
WDR53Q7Z5U6 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
WDR53Q7Z5U6 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
WDR53Q7Z5U6 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
WDR53Q7Z5U6 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
WDR53Q7Z5U6 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
WDR53Q7Z5U6 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
WDR53Q7Z5U6 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
WDR53Q7Z5U6 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
WDR53Q7Z5U6 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
WDR53Q7Z5U6 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
WDR53Q7Z5U6 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
WDR53Q7Z5U6 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
WDR53Q7Z5U6 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
WDR53Q7Z5U6 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
WDR53Q7Z5U6 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
WDR53Q7Z5U6 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
WDR53Q7Z5U6 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
WDR53Q7Z5U6 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
WDR53Q7Z5U6 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
WDR53Q7Z5U6 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
WDR53Q7Z5U6 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
WDR53Q7Z5U6 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
WDR53Q7Z5U6 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
WDR53Q7Z5U6 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
WDR53Q7Z5U6 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
WDR53Q7Z5U6 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
WDR53Q7Z5U6 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
WDR53Q7Z5U6 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
WDR53Q7Z5U6 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
WDR53Q7Z5U6 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
WDR53Q7Z5U6 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
WDR53Q7Z5U6 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
WDR53Q7Z5U6 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
WDR53Q7Z5U6 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
WDR53Q7Z5U6 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
WDR53Q7Z5U6 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
WDR53Q7Z5U6 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
WDR53Q7Z5U6 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
WDR53Q7Z5U6 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
WDR53Q7Z5U6 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
WDR53Q7Z5U6 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
WDR53Q7Z5U6 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
WDR53Q7Z5U6 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
WDR53Q7Z5U6 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
WDR53Q7Z5U6 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
WDR53Q7Z5U6 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
WDR53Q7Z5U6 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
WDR53Q7Z5U6 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
WDR53Q7Z5U6 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
WDR53Q7Z5U6 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
WDR53Q7Z5U6 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 979.7 ms