Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z2X4

PID1, PTB-containing, cubilin and LRP1-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 250 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PID1Q7Z2X4 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
PID1Q7Z2X4 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PID1Q7Z2X4 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PID1Q7Z2X4 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PID1Q7Z2X4 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PID1Q7Z2X4 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PID1Q7Z2X4 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PID1Q7Z2X4 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
PID1Q7Z2X4 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PID1Q7Z2X4 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PID1Q7Z2X4 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PID1Q7Z2X4 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PID1Q7Z2X4 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PID1Q7Z2X4 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PID1Q7Z2X4 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PID1Q7Z2X4 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PID1Q7Z2X4 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PID1Q7Z2X4 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PID1Q7Z2X4 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PID1Q7Z2X4 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PID1Q7Z2X4 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PID1Q7Z2X4 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PID1Q7Z2X4 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PID1Q7Z2X4 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PID1Q7Z2X4 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PID1Q7Z2X4 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PID1Q7Z2X4 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PID1Q7Z2X4 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PID1Q7Z2X4 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PID1Q7Z2X4 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
PID1Q7Z2X4 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PID1Q7Z2X4 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PID1Q7Z2X4 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PID1Q7Z2X4 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PID1Q7Z2X4 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PID1Q7Z2X4 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
PID1Q7Z2X4 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PID1Q7Z2X4 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PID1Q7Z2X4 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PID1Q7Z2X4 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PID1Q7Z2X4 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PID1Q7Z2X4 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PID1Q7Z2X4 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PID1Q7Z2X4 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PID1Q7Z2X4 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PID1Q7Z2X4 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PID1Q7Z2X4 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PID1Q7Z2X4 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PID1Q7Z2X4 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PID1Q7Z2X4 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PID1Q7Z2X4 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PID1Q7Z2X4 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
PID1Q7Z2X4 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
PID1Q7Z2X4 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
PID1Q7Z2X4 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PID1Q7Z2X4 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PID1Q7Z2X4 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PID1Q7Z2X4 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PID1Q7Z2X4 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PID1Q7Z2X4 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
PID1Q7Z2X4 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PID1Q7Z2X4 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
PID1Q7Z2X4 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PID1Q7Z2X4 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
PID1Q7Z2X4 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
PID1Q7Z2X4 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
PID1Q7Z2X4 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
PID1Q7Z2X4 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
PID1Q7Z2X4 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
PID1Q7Z2X4 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
PID1Q7Z2X4 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
PID1Q7Z2X4 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PID1Q7Z2X4 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PID1Q7Z2X4 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PID1Q7Z2X4 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PID1Q7Z2X4 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PID1Q7Z2X4 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
PID1Q7Z2X4 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
PID1Q7Z2X4 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PID1Q7Z2X4 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PID1Q7Z2X4 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PID1Q7Z2X4 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PID1Q7Z2X4 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PID1Q7Z2X4 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PID1Q7Z2X4 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PID1Q7Z2X4 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PID1Q7Z2X4 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PID1Q7Z2X4 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PID1Q7Z2X4 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PID1Q7Z2X4 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PID1Q7Z2X4 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PID1Q7Z2X4 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PID1Q7Z2X4 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PID1Q7Z2X4 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PID1Q7Z2X4 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PID1Q7Z2X4 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PID1Q7Z2X4 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PID1Q7Z2X4 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PID1Q7Z2X4 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PID1Q7Z2X4 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms