Protein–RNA interactions for Protein: Q6JVE5

LCN12, Epididymal-specific lipocalin-12, humanhuman

Predictions only

Length 192 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCN12Q6JVE5 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
LCN12Q6JVE5 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
LCN12Q6JVE5 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
LCN12Q6JVE5 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
LCN12Q6JVE5 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
LCN12Q6JVE5 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
LCN12Q6JVE5 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
LCN12Q6JVE5 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
LCN12Q6JVE5 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
LCN12Q6JVE5 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
LCN12Q6JVE5 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
LCN12Q6JVE5 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
LCN12Q6JVE5 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
LCN12Q6JVE5 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
LCN12Q6JVE5 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
LCN12Q6JVE5 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
LCN12Q6JVE5 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
LCN12Q6JVE5 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
LCN12Q6JVE5 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
LCN12Q6JVE5 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
LCN12Q6JVE5 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
LCN12Q6JVE5 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
LCN12Q6JVE5 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
LCN12Q6JVE5 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
LCN12Q6JVE5 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
LCN12Q6JVE5 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
LCN12Q6JVE5 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
LCN12Q6JVE5 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
LCN12Q6JVE5 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
LCN12Q6JVE5 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
LCN12Q6JVE5 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
LCN12Q6JVE5 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
LCN12Q6JVE5 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
LCN12Q6JVE5 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
LCN12Q6JVE5 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
LCN12Q6JVE5 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
LCN12Q6JVE5 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
LCN12Q6JVE5 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
LCN12Q6JVE5 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
LCN12Q6JVE5 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
LCN12Q6JVE5 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
LCN12Q6JVE5 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
LCN12Q6JVE5 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
LCN12Q6JVE5 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
LCN12Q6JVE5 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
LCN12Q6JVE5 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
LCN12Q6JVE5 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
LCN12Q6JVE5 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC19.43■□□□□ 0.7
LCN12Q6JVE5 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
LCN12Q6JVE5 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
LCN12Q6JVE5 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
LCN12Q6JVE5 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
LCN12Q6JVE5 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
LCN12Q6JVE5 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
LCN12Q6JVE5 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
LCN12Q6JVE5 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
LCN12Q6JVE5 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
LCN12Q6JVE5 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
LCN12Q6JVE5 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
LCN12Q6JVE5 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
LCN12Q6JVE5 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
LCN12Q6JVE5 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
LCN12Q6JVE5 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
LCN12Q6JVE5 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
LCN12Q6JVE5 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
LCN12Q6JVE5 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
LCN12Q6JVE5 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
LCN12Q6JVE5 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
LCN12Q6JVE5 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
LCN12Q6JVE5 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
LCN12Q6JVE5 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
LCN12Q6JVE5 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
LCN12Q6JVE5 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
LCN12Q6JVE5 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC19.4■□□□□ 0.7
LCN12Q6JVE5 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
LCN12Q6JVE5 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
LCN12Q6JVE5 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
LCN12Q6JVE5 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
LCN12Q6JVE5 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
LCN12Q6JVE5 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
LCN12Q6JVE5 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
LCN12Q6JVE5 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
LCN12Q6JVE5 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
LCN12Q6JVE5 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC19.38■□□□□ 0.69
LCN12Q6JVE5 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
LCN12Q6JVE5 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
LCN12Q6JVE5 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
LCN12Q6JVE5 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
LCN12Q6JVE5 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
LCN12Q6JVE5 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
LCN12Q6JVE5 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
LCN12Q6JVE5 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
LCN12Q6JVE5 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
LCN12Q6JVE5 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
LCN12Q6JVE5 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
LCN12Q6JVE5 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
LCN12Q6JVE5 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
LCN12Q6JVE5 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
LCN12Q6JVE5 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
LCN12Q6JVE5 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms