Protein–RNA interactions for Protein: Q6GYQ0

RALGAPA1, Ral GTPase-activating protein subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 2,036 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RALGAPA1Q6GYQ0 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RALGAPA1Q6GYQ0 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RALGAPA1Q6GYQ0 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RALGAPA1Q6GYQ0 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RALGAPA1Q6GYQ0 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RALGAPA1Q6GYQ0 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RALGAPA1Q6GYQ0 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RALGAPA1Q6GYQ0 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RALGAPA1Q6GYQ0 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RALGAPA1Q6GYQ0 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RALGAPA1Q6GYQ0 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RALGAPA1Q6GYQ0 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
RALGAPA1Q6GYQ0 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RALGAPA1Q6GYQ0 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
RALGAPA1Q6GYQ0 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RALGAPA1Q6GYQ0 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RALGAPA1Q6GYQ0 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RALGAPA1Q6GYQ0 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RALGAPA1Q6GYQ0 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RALGAPA1Q6GYQ0 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RALGAPA1Q6GYQ0 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
RALGAPA1Q6GYQ0 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
RALGAPA1Q6GYQ0 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
RALGAPA1Q6GYQ0 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
RALGAPA1Q6GYQ0 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RALGAPA1Q6GYQ0 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RALGAPA1Q6GYQ0 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RALGAPA1Q6GYQ0 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RALGAPA1Q6GYQ0 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RALGAPA1Q6GYQ0 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RALGAPA1Q6GYQ0 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RALGAPA1Q6GYQ0 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RALGAPA1Q6GYQ0 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RALGAPA1Q6GYQ0 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RALGAPA1Q6GYQ0 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RALGAPA1Q6GYQ0 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RALGAPA1Q6GYQ0 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RALGAPA1Q6GYQ0 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RALGAPA1Q6GYQ0 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
RALGAPA1Q6GYQ0 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RALGAPA1Q6GYQ0 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RALGAPA1Q6GYQ0 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RALGAPA1Q6GYQ0 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
RALGAPA1Q6GYQ0 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
RALGAPA1Q6GYQ0 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RALGAPA1Q6GYQ0 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RALGAPA1Q6GYQ0 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RALGAPA1Q6GYQ0 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RALGAPA1Q6GYQ0 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RALGAPA1Q6GYQ0 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RALGAPA1Q6GYQ0 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RALGAPA1Q6GYQ0 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RALGAPA1Q6GYQ0 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RALGAPA1Q6GYQ0 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RALGAPA1Q6GYQ0 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
RALGAPA1Q6GYQ0 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RALGAPA1Q6GYQ0 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RALGAPA1Q6GYQ0 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RALGAPA1Q6GYQ0 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RALGAPA1Q6GYQ0 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RALGAPA1Q6GYQ0 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RALGAPA1Q6GYQ0 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
RALGAPA1Q6GYQ0 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
RALGAPA1Q6GYQ0 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RALGAPA1Q6GYQ0 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RALGAPA1Q6GYQ0 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RALGAPA1Q6GYQ0 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RALGAPA1Q6GYQ0 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RALGAPA1Q6GYQ0 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RALGAPA1Q6GYQ0 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RALGAPA1Q6GYQ0 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RALGAPA1Q6GYQ0 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
RALGAPA1Q6GYQ0 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RALGAPA1Q6GYQ0 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RALGAPA1Q6GYQ0 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
RALGAPA1Q6GYQ0 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RALGAPA1Q6GYQ0 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RALGAPA1Q6GYQ0 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RALGAPA1Q6GYQ0 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RALGAPA1Q6GYQ0 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RALGAPA1Q6GYQ0 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RALGAPA1Q6GYQ0 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RALGAPA1Q6GYQ0 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RALGAPA1Q6GYQ0 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RALGAPA1Q6GYQ0 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RALGAPA1Q6GYQ0 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RALGAPA1Q6GYQ0 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RALGAPA1Q6GYQ0 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RALGAPA1Q6GYQ0 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
RALGAPA1Q6GYQ0 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
RALGAPA1Q6GYQ0 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RALGAPA1Q6GYQ0 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RALGAPA1Q6GYQ0 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RALGAPA1Q6GYQ0 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RALGAPA1Q6GYQ0 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RALGAPA1Q6GYQ0 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RALGAPA1Q6GYQ0 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RALGAPA1Q6GYQ0 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
RALGAPA1Q6GYQ0 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RALGAPA1Q6GYQ0 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms