Protein–RNA interactions for Protein: Q5VU43

PDE4DIP, Myomegalin, humanhuman

Predictions only

Length 2,346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4DIPQ5VU43 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
PDE4DIPQ5VU43 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
PDE4DIPQ5VU43 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PDE4DIPQ5VU43 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PDE4DIPQ5VU43 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC28.47■■■□□ 2.15
PDE4DIPQ5VU43 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
PDE4DIPQ5VU43 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
PDE4DIPQ5VU43 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PDE4DIPQ5VU43 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
PDE4DIPQ5VU43 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
PDE4DIPQ5VU43 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
PDE4DIPQ5VU43 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PDE4DIPQ5VU43 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
PDE4DIPQ5VU43 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
PDE4DIPQ5VU43 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
PDE4DIPQ5VU43 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
PDE4DIPQ5VU43 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
PDE4DIPQ5VU43 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
PDE4DIPQ5VU43 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
PDE4DIPQ5VU43 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
PDE4DIPQ5VU43 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PDE4DIPQ5VU43 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
PDE4DIPQ5VU43 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PDE4DIPQ5VU43 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
PDE4DIPQ5VU43 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PDE4DIPQ5VU43 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PDE4DIPQ5VU43 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PDE4DIPQ5VU43 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PDE4DIPQ5VU43 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
PDE4DIPQ5VU43 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
PDE4DIPQ5VU43 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PDE4DIPQ5VU43 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
PDE4DIPQ5VU43 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PDE4DIPQ5VU43 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
PDE4DIPQ5VU43 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
PDE4DIPQ5VU43 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
PDE4DIPQ5VU43 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
PDE4DIPQ5VU43 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PDE4DIPQ5VU43 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
PDE4DIPQ5VU43 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
PDE4DIPQ5VU43 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PDE4DIPQ5VU43 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PDE4DIPQ5VU43 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
PDE4DIPQ5VU43 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
PDE4DIPQ5VU43 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PDE4DIPQ5VU43 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PDE4DIPQ5VU43 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
PDE4DIPQ5VU43 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
PDE4DIPQ5VU43 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
PDE4DIPQ5VU43 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PDE4DIPQ5VU43 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PDE4DIPQ5VU43 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PDE4DIPQ5VU43 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PDE4DIPQ5VU43 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PDE4DIPQ5VU43 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PDE4DIPQ5VU43 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PDE4DIPQ5VU43 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PDE4DIPQ5VU43 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
PDE4DIPQ5VU43 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
PDE4DIPQ5VU43 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PDE4DIPQ5VU43 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
PDE4DIPQ5VU43 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PDE4DIPQ5VU43 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PDE4DIPQ5VU43 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PDE4DIPQ5VU43 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
PDE4DIPQ5VU43 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
PDE4DIPQ5VU43 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PDE4DIPQ5VU43 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
PDE4DIPQ5VU43 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
PDE4DIPQ5VU43 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
PDE4DIPQ5VU43 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
PDE4DIPQ5VU43 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
PDE4DIPQ5VU43 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PDE4DIPQ5VU43 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PDE4DIPQ5VU43 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
PDE4DIPQ5VU43 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
PDE4DIPQ5VU43 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
PDE4DIPQ5VU43 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PDE4DIPQ5VU43 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PDE4DIPQ5VU43 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
PDE4DIPQ5VU43 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PDE4DIPQ5VU43 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PDE4DIPQ5VU43 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
PDE4DIPQ5VU43 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
PDE4DIPQ5VU43 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PDE4DIPQ5VU43 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PDE4DIPQ5VU43 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PDE4DIPQ5VU43 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PDE4DIPQ5VU43 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PDE4DIPQ5VU43 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PDE4DIPQ5VU43 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PDE4DIPQ5VU43 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
PDE4DIPQ5VU43 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PDE4DIPQ5VU43 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PDE4DIPQ5VU43 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PDE4DIPQ5VU43 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
PDE4DIPQ5VU43 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PDE4DIPQ5VU43 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
PDE4DIPQ5VU43 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PDE4DIPQ5VU43 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms