Protein–RNA interactions for Protein: Q5T890

ERCC6L2, DNA excision repair protein ERCC-6-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,561 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC6L2Q5T890 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC41.26■■■■■ 4.2
ERCC6L2Q5T890 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC41.26■■■■■ 4.2
ERCC6L2Q5T890 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC41.25■■■■■ 4.19
ERCC6L2Q5T890 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC41.25■■■■■ 4.19
ERCC6L2Q5T890 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC41.25■■■■■ 4.19
ERCC6L2Q5T890 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC41.23■■■■■ 4.19
ERCC6L2Q5T890 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC41.22■■■■■ 4.19
ERCC6L2Q5T890 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC41.21■■■■■ 4.19
ERCC6L2Q5T890 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC41.21■■■■■ 4.19
ERCC6L2Q5T890 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC41.21■■■■■ 4.19
ERCC6L2Q5T890 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.2■■■■■ 4.19
ERCC6L2Q5T890 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC41.19■■■■■ 4.19
ERCC6L2Q5T890 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.19■■■■■ 4.18
ERCC6L2Q5T890 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.19■■■■■ 4.18
ERCC6L2Q5T890 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC41.19■■■■■ 4.18
ERCC6L2Q5T890 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC41.18■■■■■ 4.18
ERCC6L2Q5T890 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC41.18■■■■■ 4.18
ERCC6L2Q5T890 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.18■■■■■ 4.18
ERCC6L2Q5T890 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC41.18■■■■■ 4.18
ERCC6L2Q5T890 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC41.18■■■■■ 4.18
ERCC6L2Q5T890 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.17■■■■■ 4.18
ERCC6L2Q5T890 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC41.17■■■■■ 4.18
ERCC6L2Q5T890 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.17■■■■■ 4.18
ERCC6L2Q5T890 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC41.16■■■■■ 4.18
ERCC6L2Q5T890 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC41.16■■■■■ 4.18
ERCC6L2Q5T890 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.15■■■■■ 4.18
ERCC6L2Q5T890 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.15■■■■■ 4.18
ERCC6L2Q5T890 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC41.15■■■■■ 4.18
ERCC6L2Q5T890 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC41.15■■■■■ 4.18
ERCC6L2Q5T890 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC41.14■■■■■ 4.18
ERCC6L2Q5T890 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.14■■■■■ 4.18
ERCC6L2Q5T890 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC41.14■■■■■ 4.18
ERCC6L2Q5T890 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC41.13■■■■■ 4.18
ERCC6L2Q5T890 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.13■■■■■ 4.17
ERCC6L2Q5T890 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC41.13■■■■■ 4.17
ERCC6L2Q5T890 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.12■■■■■ 4.17
ERCC6L2Q5T890 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC41.12■■■■■ 4.17
ERCC6L2Q5T890 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.12■■■■■ 4.17
ERCC6L2Q5T890 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC41.12■■■■■ 4.17
ERCC6L2Q5T890 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.1■■■■■ 4.17
ERCC6L2Q5T890 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC41.1■■■■■ 4.17
ERCC6L2Q5T890 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC41.1■■■■■ 4.17
ERCC6L2Q5T890 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.1■■■■■ 4.17
ERCC6L2Q5T890 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC41.09■■■■■ 4.17
ERCC6L2Q5T890 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.08■■■■■ 4.17
ERCC6L2Q5T890 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC41.08■■■■■ 4.17
ERCC6L2Q5T890 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC41.07■■■■■ 4.16
ERCC6L2Q5T890 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC41.07■■■■■ 4.16
ERCC6L2Q5T890 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC41.06■■■■■ 4.16
ERCC6L2Q5T890 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.05■■■■■ 4.16
ERCC6L2Q5T890 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.05■■■■■ 4.16
ERCC6L2Q5T890 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.04■■■■■ 4.16
ERCC6L2Q5T890 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC41.04■■■■■ 4.16
ERCC6L2Q5T890 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.04■■■■■ 4.16
ERCC6L2Q5T890 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC41.04■■■■■ 4.16
ERCC6L2Q5T890 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.04■■■■■ 4.16
ERCC6L2Q5T890 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.04■■■■■ 4.16
ERCC6L2Q5T890 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC41.03■■■■■ 4.16
ERCC6L2Q5T890 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC41.03■■■■■ 4.16
ERCC6L2Q5T890 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.01■■■■■ 4.16
ERCC6L2Q5T890 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC41■■■■■ 4.15
ERCC6L2Q5T890 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.99■■■■■ 4.15
ERCC6L2Q5T890 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.98■■■■■ 4.15
ERCC6L2Q5T890 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.98■■■■■ 4.15
ERCC6L2Q5T890 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC40.98■■■■■ 4.15
ERCC6L2Q5T890 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC40.98■■■■■ 4.15
ERCC6L2Q5T890 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC40.98■■■■■ 4.15
ERCC6L2Q5T890 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.97■■■■■ 4.15
ERCC6L2Q5T890 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.96■■■■■ 4.15
ERCC6L2Q5T890 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC40.96■■■■■ 4.15
ERCC6L2Q5T890 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.96■■■■■ 4.15
ERCC6L2Q5T890 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC40.96■■■■■ 4.15
ERCC6L2Q5T890 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.96■■■■■ 4.15
ERCC6L2Q5T890 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.95■■■■■ 4.15
ERCC6L2Q5T890 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC40.95■■■■■ 4.15
ERCC6L2Q5T890 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.94■■■■■ 4.14
ERCC6L2Q5T890 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC40.94■■■■■ 4.14
ERCC6L2Q5T890 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC40.94■■■■■ 4.14
ERCC6L2Q5T890 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC40.94■■■■■ 4.14
ERCC6L2Q5T890 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.93■■■■■ 4.14
ERCC6L2Q5T890 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC40.93■■■■■ 4.14
ERCC6L2Q5T890 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC40.93■■■■■ 4.14
ERCC6L2Q5T890 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC40.93■■■■■ 4.14
ERCC6L2Q5T890 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC40.93■■■■■ 4.14
ERCC6L2Q5T890 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.93■■■■■ 4.14
ERCC6L2Q5T890 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC40.93■■■■■ 4.14
ERCC6L2Q5T890 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.92■■■■■ 4.14
ERCC6L2Q5T890 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.92■■■■■ 4.14
ERCC6L2Q5T890 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.92■■■■■ 4.14
ERCC6L2Q5T890 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC40.91■■■■■ 4.14
ERCC6L2Q5T890 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.91■■■■■ 4.14
ERCC6L2Q5T890 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC40.91■■■■■ 4.14
ERCC6L2Q5T890 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC40.91■■■■■ 4.14
ERCC6L2Q5T890 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC40.91■■■■■ 4.14
ERCC6L2Q5T890 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC40.91■■■■■ 4.14
ERCC6L2Q5T890 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.91■■■■■ 4.14
ERCC6L2Q5T890 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.91■■■■■ 4.14
ERCC6L2Q5T890 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC40.9■■■■■ 4.14
ERCC6L2Q5T890 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC40.89■■■■■ 4.14
ERCC6L2Q5T890 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.89■■■■■ 4.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.9 ms