Protein–RNA interactions for Protein: Q494X3

ZNF404, Zinc finger protein 404, humanhuman

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF404Q494X3 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ZNF404Q494X3 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ZNF404Q494X3 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ZNF404Q494X3 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ZNF404Q494X3 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ZNF404Q494X3 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ZNF404Q494X3 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ZNF404Q494X3 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
ZNF404Q494X3 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZNF404Q494X3 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZNF404Q494X3 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZNF404Q494X3 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZNF404Q494X3 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZNF404Q494X3 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZNF404Q494X3 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZNF404Q494X3 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZNF404Q494X3 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZNF404Q494X3 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZNF404Q494X3 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZNF404Q494X3 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZNF404Q494X3 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZNF404Q494X3 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZNF404Q494X3 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZNF404Q494X3 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZNF404Q494X3 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZNF404Q494X3 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZNF404Q494X3 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZNF404Q494X3 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZNF404Q494X3 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZNF404Q494X3 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZNF404Q494X3 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZNF404Q494X3 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZNF404Q494X3 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZNF404Q494X3 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZNF404Q494X3 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
ZNF404Q494X3 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZNF404Q494X3 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
ZNF404Q494X3 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZNF404Q494X3 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZNF404Q494X3 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZNF404Q494X3 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZNF404Q494X3 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZNF404Q494X3 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNF404Q494X3 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNF404Q494X3 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNF404Q494X3 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNF404Q494X3 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNF404Q494X3 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNF404Q494X3 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNF404Q494X3 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNF404Q494X3 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNF404Q494X3 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZNF404Q494X3 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZNF404Q494X3 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZNF404Q494X3 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZNF404Q494X3 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZNF404Q494X3 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZNF404Q494X3 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZNF404Q494X3 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZNF404Q494X3 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZNF404Q494X3 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZNF404Q494X3 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
ZNF404Q494X3 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZNF404Q494X3 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZNF404Q494X3 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZNF404Q494X3 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZNF404Q494X3 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZNF404Q494X3 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZNF404Q494X3 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZNF404Q494X3 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZNF404Q494X3 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZNF404Q494X3 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZNF404Q494X3 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZNF404Q494X3 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZNF404Q494X3 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZNF404Q494X3 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZNF404Q494X3 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZNF404Q494X3 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZNF404Q494X3 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZNF404Q494X3 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZNF404Q494X3 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
ZNF404Q494X3 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZNF404Q494X3 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZNF404Q494X3 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
ZNF404Q494X3 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZNF404Q494X3 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZNF404Q494X3 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZNF404Q494X3 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZNF404Q494X3 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZNF404Q494X3 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZNF404Q494X3 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
ZNF404Q494X3 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZNF404Q494X3 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZNF404Q494X3 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZNF404Q494X3 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZNF404Q494X3 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZNF404Q494X3 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZNF404Q494X3 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZNF404Q494X3 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZNF404Q494X3 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms