Protein–RNA interactions for Protein: Q16143

SNCB, Beta-synuclein, humanhuman

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Length 134 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNCBQ16143 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SNCBQ16143 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SNCBQ16143 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SNCBQ16143 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SNCBQ16143 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SNCBQ16143 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SNCBQ16143 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SNCBQ16143 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SNCBQ16143 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SNCBQ16143 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SNCBQ16143 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SNCBQ16143 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SNCBQ16143 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SNCBQ16143 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SNCBQ16143 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SNCBQ16143 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SNCBQ16143 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SNCBQ16143 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SNCBQ16143 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SNCBQ16143 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SNCBQ16143 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
SNCBQ16143 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SNCBQ16143 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SNCBQ16143 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SNCBQ16143 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SNCBQ16143 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SNCBQ16143 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SNCBQ16143 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SNCBQ16143 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SNCBQ16143 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SNCBQ16143 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SNCBQ16143 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SNCBQ16143 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SNCBQ16143 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SNCBQ16143 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SNCBQ16143 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SNCBQ16143 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SNCBQ16143 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SNCBQ16143 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SNCBQ16143 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SNCBQ16143 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SNCBQ16143 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SNCBQ16143 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SNCBQ16143 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
SNCBQ16143 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
SNCBQ16143 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SNCBQ16143 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SNCBQ16143 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SNCBQ16143 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SNCBQ16143 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SNCBQ16143 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SNCBQ16143 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SNCBQ16143 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SNCBQ16143 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SNCBQ16143 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SNCBQ16143 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SNCBQ16143 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SNCBQ16143 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SNCBQ16143 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SNCBQ16143 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SNCBQ16143 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SNCBQ16143 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
SNCBQ16143 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SNCBQ16143 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SNCBQ16143 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SNCBQ16143 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SNCBQ16143 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SNCBQ16143 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SNCBQ16143 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SNCBQ16143 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SNCBQ16143 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SNCBQ16143 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SNCBQ16143 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SNCBQ16143 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SNCBQ16143 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SNCBQ16143 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SNCBQ16143 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SNCBQ16143 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SNCBQ16143 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
SNCBQ16143 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SNCBQ16143 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SNCBQ16143 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SNCBQ16143 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SNCBQ16143 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SNCBQ16143 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SNCBQ16143 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SNCBQ16143 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SNCBQ16143 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SNCBQ16143 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SNCBQ16143 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SNCBQ16143 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SNCBQ16143 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SNCBQ16143 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SNCBQ16143 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SNCBQ16143 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SNCBQ16143 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
SNCBQ16143 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
SNCBQ16143 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SNCBQ16143 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SNCBQ16143 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
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