Protein–RNA interactions for Protein: Q16134

ETFDH, Electron transfer flavoprotein-ubiquinone oxidoreductase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ETFDHQ16134 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ETFDHQ16134 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ETFDHQ16134 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ETFDHQ16134 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ETFDHQ16134 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ETFDHQ16134 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ETFDHQ16134 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ETFDHQ16134 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ETFDHQ16134 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ETFDHQ16134 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
ETFDHQ16134 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
ETFDHQ16134 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
ETFDHQ16134 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
ETFDHQ16134 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ETFDHQ16134 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ETFDHQ16134 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ETFDHQ16134 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ETFDHQ16134 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ETFDHQ16134 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ETFDHQ16134 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ETFDHQ16134 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ETFDHQ16134 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ETFDHQ16134 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ETFDHQ16134 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ETFDHQ16134 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ETFDHQ16134 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ETFDHQ16134 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ETFDHQ16134 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ETFDHQ16134 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ETFDHQ16134 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ETFDHQ16134 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ETFDHQ16134 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ETFDHQ16134 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ETFDHQ16134 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ETFDHQ16134 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ETFDHQ16134 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ETFDHQ16134 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ETFDHQ16134 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ETFDHQ16134 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ETFDHQ16134 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ETFDHQ16134 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ETFDHQ16134 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ETFDHQ16134 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ETFDHQ16134 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
ETFDHQ16134 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ETFDHQ16134 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ETFDHQ16134 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ETFDHQ16134 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ETFDHQ16134 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ETFDHQ16134 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ETFDHQ16134 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ETFDHQ16134 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ETFDHQ16134 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ETFDHQ16134 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ETFDHQ16134 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ETFDHQ16134 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ETFDHQ16134 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
ETFDHQ16134 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ETFDHQ16134 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ETFDHQ16134 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ETFDHQ16134 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ETFDHQ16134 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ETFDHQ16134 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ETFDHQ16134 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ETFDHQ16134 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ETFDHQ16134 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ETFDHQ16134 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ETFDHQ16134 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ETFDHQ16134 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ETFDHQ16134 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ETFDHQ16134 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ETFDHQ16134 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ETFDHQ16134 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ETFDHQ16134 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ETFDHQ16134 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ETFDHQ16134 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ETFDHQ16134 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ETFDHQ16134 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ETFDHQ16134 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ETFDHQ16134 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ETFDHQ16134 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ETFDHQ16134 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ETFDHQ16134 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ETFDHQ16134 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ETFDHQ16134 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ETFDHQ16134 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ETFDHQ16134 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ETFDHQ16134 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ETFDHQ16134 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ETFDHQ16134 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
ETFDHQ16134 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
ETFDHQ16134 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ETFDHQ16134 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ETFDHQ16134 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ETFDHQ16134 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ETFDHQ16134 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ETFDHQ16134 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ETFDHQ16134 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ETFDHQ16134 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ETFDHQ16134 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.4 ms